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Enregistrement W4389024721 · doi:10.1096/fasebj.31.1_supplement.1008.4

First identification of mutations in the human SLC5A6 gene associated with brain, immune, bone and intestinal dysfunction

2017· article· en· W4389024721 sur OpenAlexfundno aff
Veedamali S. Subramanian, Paul J. Benke, Alexandru R. Constantinescu, Hamid M. Said

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiotin and Related Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthDepartment of Veterans' Affairs, Australian GovernmentGordon Foundation
Mots-clésBiologyMutationMolecular biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biotin (vitamin B7) is indispensable for normal cellular metabolism due to its involvement in a variety of critical metabolic pathways including fatty acid, amino acid and energy metabolism; it also plays a role in regulating cellular level of reactive oxygen species and gene expression, as well as normal immune function/response. Human (mammalian) cells cannot synthesize biotin endogenously; rather they obtain the vitamin across the plasma membrane via a carrier‐mediated uptake process that involves the human sodium‐dependent multivitamin transporter (hSMVT; product of the SLC5A6 gene); this system also transports pantothenic acid and lipoate. We report here, using whole exome sequencing (GeneDx), the first identification of two mutations in the SLC5A6 gene in a young child: R94X [(CGA>TGA) c280 C>T] and R123L [(CGC>CTC), c368 G>T]. Both of these mutations are located in exon 3 of the SLC5A6 gene. The child exhibited many clinical manifestations including failure to thrive, microcephaly, brain changes, cerebral palsy, developmental delay, immunodeficiency, severe gastro‐esophageal reflux, osteoporosis and pathologic bone fractures. After identification of the hSMVT mutations, the child responded favorably to supplemental administration of pharmacological doses of biotin, pantothenic acid and lipoate. Experimental characterization of the identified mutations utilizing human‐derived intestinal HuTu‐80 and brain U87 cell lines, showed impaired functionality (3H‐biotin uptake) of the two identified hSMVT mutants. In addition, our results (using live‐cell confocal imaging) showed poor expression and cytoplasmic localization of the R94X mutant, while the R123L mutant was predominantly retained in the endoplasmic reticulum. This is the first reporting of mutations in the human SLC5A6 gene that lead to defects in hSMVT function and cell biology, and is associated with a host of clinical abnormalities. Support or Funding Information Supported by a grant from the DVA, by NIH grants DK58057, DK56057, DK10747, and the Gordon Foundation

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,816
Score d'incertitude au seuil0,652

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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