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Enregistrement W4389025549 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.430.4

Depletion of Programmed Cell Death Protein 4 (PDCD4), an mTORC1/S6K1 Substrate, Attenuates Proteolysis in L6 Myotubes

2016· article· en· W4389025549 sur OpenAlexafffund
Olasunkanmi John Adegoke, Sidney Abou Sawan

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaYork University
Mots-clésmTORC1P70-S6 Kinase 1ProteolysisProtein biosynthesisProtein degradationCell biologyRibosomal protein s6BiochemistryChemistryPolysomeProgrammed cell deathBiologyPhosphorylationProtein kinase BRNAApoptosisRibosomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mammalian (mechanistic) target of rapamycin complex 1/ribosomal S6 Protein kinase 1 (mTORC1/S6K1) signaling pathway is a critical regulator of skeletal muscle protein synthesis and mass. Because mTORC1 signaling is also implicated in autophagy control, regulation of muscle protein mass by mTORC1 may be mediated by regulation of protein synthesis and/or degradation. We recently characterized the expression of programmed cell death protein 4 (PDCD4), a substrate of mTORC1/S6K1, in skeletal muscle. This pro apoptotic protein normally inhibits mRNA translation by binding to eukaryotic translation initiation factor 4A (eIF4A), but upon phosphorylation by S6K1, it is targeted for proteolysis by the ubiquitin dependent proteolytic system. Depletion of PDCD4 in myoblasts attenuated the suppression of protein synthesis that is normally observed in response to amino acid starvation. Surprisingly in myotubes, PDCD4 depletion led to a reduction in protein synthesis. This led us to hypothesize that PDCD4 likely regulates both protein synthesis and degradation, and that its depletion would lead to a greater suppression of proteolysis (compared to suppression of protein synthesis), thus leading to positive protein balance. L6 myotubes were depleted of PDCD4 by RNA interference. Thirty‐six hours later, cells were pulsed with S‐35 methionine/cysteine for 12 hours. To activate proteolysis, cells were then incubated either in amino acid‐free medium (starvation), or in 1 μM dexamethasone for varying lengths of time. Samples were then harvested and subjected to autoradiography to measure residual radioactivity. At 24–36 hours, starvation increased the disappearance of radiolabeled protein by 50–80% compared with non‐starved cells ( P <0.05), consistent with increased proteolysis. In PDCD4 depleted cells, starvation‐induced proteolysis was suppressed by 40–60% ( P <0.05). Ubiquitinated proteins accumulated to a greater extent (40–100%) in starved PDCD4‐depleted cells compared to cells treated with control siRNA ( P <0.05), consistent with inhibition of degradation of ubiquitinated proteins. In dexamethasone treated cells, proteolysis was inhibited by ~20% in PDCD4 depleted cells compared to cells treated with control siRNA ( P <0.001). These data are consistent with a role for PDCD4 in regulating not only protein synthesis but also proteolysis. Therefore, interventions that target PDCD4 may help in limiting muscle proteolysis seen in catabolic conditions like cancer and insulin resistance states. Support or Funding Information NSERC; York University

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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