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Enregistrement W4389025605 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.378.3

O‐GlcNAc occurs cotranslationally to stabilize nascent polypeptides

2016· article· en· W4389025605 sur OpenAlexafffundabout
David J. Vocadlo, Yanping Zhu, Ta‐Wei Liu, Samy Cecioni, Raieh Eskandari, Wesley F. Zandberg, Lianne I. Willems

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGlycosylationRibosomeBiologyProteostasisCell biologyBiochemistryChemistryGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nucleocytoplasmic glycosylation of proteins with O‐linked N‐acetylglucosamine residues (O‐GlcNAc) is mediated by the glycosyltransferase O‐GlcNAc transferase (OGT). O‐GlcNAc is recognized as a common post‐translational modification and is found on hundreds of proteins within all metazoans studied to date. O‐GlcNAc has emerged as a regulator of diverse cellular processes ranging from gene expression through to circadian rhythm. Notably, impairments in cellular O‐GlcNAcylation have been found to lead to decreases in the levels of various proteins and this is one mechanism by which O‐GlcNAc seems to exert its varied physiological effects. Here we use a chemical biology approach in combination with biochemical fractionation to show that O‐GlcNAcylation also occurs on polypeptides that are emerging from the ribosome. Using both chemical and genetic blockade of OGT we show that this cotranslational O‐GlcNAcylation protects nascent polypeptide chains from premature degradation by decreasing their cotranslational ubiquitylation. Given that hundreds of proteins are O‐GlcNAcylated within cells, our findings suggest that cotranslational O‐GlcNAcylation may be a phenomenon regulating proteostasis of an array of nucleocytoplasmic proteins. We describe our recent findings and discuss the similarities between cotranslational O‐GlcNAcylation and the roles played by cotranslational N‐glycosylation occurring within the secretory pathway. Support or Funding Information Financial support through a Discovery Grant (Grant number: RGPIN/298406‐2010) the Natural Sciences and Engineering Research (NSERC) and the Canadian Institutes of Health Research (CIHR) (Grant number: MOP‐102756) is gratefully acknowledged. Y.Z. thanks the CIHR for support through a postdoctoral fellowship. D.J.V. acknowledges the kind support of the Canada Research Chairs program for a Tier I Canada Research Chair in Chemical Glycobiology and NSERC for support as an E.W.R. Steacie Memorial Fellow.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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