Novel Interactions of Yeast Glycerol‐3‐Phosphate Acyltransferases
Notice bibliographique
Résumé
Glycerol‐3‐phosphate acyltransferases (GPATs) catalyze the first committed and rate limiting step in the de novo synthesis of glycerophospholipids and neutral triacylglycerols. GPATs transfer an acyl group from acyl‐coenzyme A to the sn‐1 position of glycerol‐3‐phosphate to produce 1‐acyl glycerol‐3‐phosphate (lysophosphatidic acid). Lysophosphatidic acid can then be further acylated by a second acyltransferase to produce phosphatidic acid, a signalling lipid and key intermediate in lipid biosynthesis. In the model organism yeast Saccharomyces cerevisiae two GPATs, Gpt2 and Sct1, have been identified. Both are integral membrane proteins located to the endoplasmic reticulum (ER), differentially enriched in ER domains. Interestingly, we have shown that Gpt2 (but not Sct1) is responsible for channeling oleate (C18:1) into triacylglycerol that is eventually stored in lipid droplets. Furthermore, our studies on oleate metabolism unveiled novel ER structures that surround lipid droplets and are differentially enriched in Gpt2 while devoid of Sct1. In addition, we also uncovered a dynamic post‐translational regulation of Gpt2 and Sct1 through phosphorylation that responds to growth phase, carbon source and cellular GPAT imbalance. The aim of this work was to understand how GPAT interactions with other proteins contribute to their spatial distribution in the ER and to lipid synthesis partitioning. In order to identify potential protein interactors, Gpt2 and Sct1 were overproduced in cells deleted for endogenous GPATs and then isolated from lysates and microsomes using co‐immuno‐affinity and Ni‐NTA affinity chromatography purification techniques. Potential interactors co‐purifying with Gpt2 or Sct1 were identified through liquid chromatography‐tandem mass spectrometry (LC‐MS/MS). Our results suggest that Gpt2 and Sct1 differentially associate with ER sites where inter‐organelle transport of lipids occurs. Of importance are the contact sites between ER‐mitochondria, ER‐lipid droplets and the nuclear‐vacuolar junction. Support or Funding Information This work was supported by an operating grant from the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada to VZ.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».