Dihydroxyacetone Phosphate Acyltransferase is a Peripheral Membrane Protein
Notice bibliographique
Résumé
Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase(DHAPAT) catalyzes the initial acylation step in the synthesis of ether basedphospholipids in peroxisomes. DHAPAT adds an acyl group to dihydroxyacetonephosphate, a metabolic intermediate from glycolysis, to yield 1‐acyl‐dihydroxyacetonephosphate (1‐acyl‐DHAP). Ether lipids are abundant in the central nervoussystem and DHAPAT deficiency has been associated with many human disordersincluding cataracts and blindness. We will present results from studies using the tractable model organism Xenopuslaevis that also point to a role of DHAPAT in eye development. Analysis of DHAPAT expression by in situ hybridization indicated it is expressed in the lens epithelium and in the proliferative region of the ciliary marginal zone. Given its relevance and how little is known about DHAPAT, we have initiated biochemical studies aimed at fully characterizing this enzyme in terms of structure, function and regulation. Using a yeast heterologous expression system we have been able to overproduce functional X. laevis DHAPAT. A first purification scheme comprised of subcellular fractionation, protein solubilization with different detergents and ionic strength conditions followed by Ni‐NTA affinity chromatography has been developed. Our studies indicate that X laevis DHAPAT is a peripheral membrane protein that can associate‐dissociate from membranes. We are currently exploiting this novel feature for this kind of acyltransferases in order to setup the conditions to improve its purification with the goal of initiating structural studies. Support or Funding Information This work was supported by operating grants from the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada to SM and VZ.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».