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Enregistrement W4389026646 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.855.1

Characterization of Heterologously Expressed Putative Cytolysins from “ <i>Brachyspira hampsonii “</i>

2016· article· en· W4389026646 sur OpenAlexafffundabout
Brandon A. Keith, John C. S. Harding, Janet E. Hill, Matthew E. Loewen

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueVeterinary medicine and infectious diseases
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésVirulenceEscherichia coliMicrobiologyBiologyHemolysinGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cytolysins produced by Brachyspira hyodysenteriae and “ Brachyspira hampsonii” strain 30446 are believed to be important virulence factors in the pathology of swine dysentery. To date four putative cytolysin genes termed tlyA, tlyB, tlyC, and hlyA have been identified, all of which are present in both Brachyspira hyodysenteriae and “ Brachyspira hampsonii” . While the contributions of tlyB, tlyC, and hlyA to the pathogenesis of swine dysentery are not yet known, tlyA knockout strains of Brachyspira hyodysenteriae have shown decreased virulence in mouse models. In addition, homologues of tlyA are believed to be important virulence factors for human pathogens such as Helicobacter pylori and Mycobacterium tuberculosis , functioning as both cytolysins and contributing to antibiotic resistance through ribosomal RNA methylation. While active hlyA protein has been purified from Brachyspira hyodysenteriae broth cultures, studies of tlyA, tlyB, and tlyC to date have focused on their activity when introduced into Escherichia coli via plasmid. These results were cast into doubt several years later upon the discovery that many lab strains of Escherichia coli exhibit a hemolytic phenotype when foreign genes were introduced. To examine the effects of these putative cytolysins the tlyA and tlyC genes were amplified from “ Brachyspira hampsonii” genomic DNA and ligated into expression vectors. The resulting protein products were overexpressed in Escherichia coli and purified by Ni 2+ and amylose affinity chromatography. Cytolytic activity of purified recombinant tlyA and tlyC on a sheep erythrocyte suspension was examined, and no cytolysis greater than a phosphate buffered saline control was observed from tlyA at concentrations ranging from 0 to 88 μg/mL or from tlyC at concentrations ranging from 0–34 μg/mL. At the time of writing, attempts are being made to express and purify the α‐toxin from Staphylococcus aureus utilizing the same methodology in order to rule out inactivation of tlyA and tlyC by the purification process. While it is also possible that higher concentrations of tlyA and tlyC are required for hemolysis or that full activity of these proteins require unidentified cofactors or post‐translational modifications not possible in our current Escherichia coli based expression system, the possibility that tlyA and tlyC have been misannotated as cytolysins cannot be ruled out. Support or Funding Information Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC) 371364 /2010 to MEL &amp; Alberta Livestock and Meat Association project 2013R054R to JCH, MEL &amp; JEH

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,124
Score d'incertitude au seuil0,984

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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