1760. Wastewater-based surveillance for influenza A and RSV and its correlation with clinical disease in Edmonton, Alberta
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Wastewater (WW)-based surveillance (WBS) of SARS-CoV-2 has been shown to provide a leading indicator to COVID-19 clinical disease including confirmed cases and associated-hospitalizations. To this point, however, longitudinal monitoring of endemic respiratory diseases such as influenza A (IAV) and respiratory syncytial virus (RSV) have minimally been explored. We sought to correlate WW measured endemic virus RNA from municipal WW treatment plants (WWTP) with clinical data to understand WBS performance for endemic respiratory disease in Alberta’s capital city, Edmonton. Methods WW was collected thrice weekly from the two WWTP servicing the Edmonton-area (population ∼1.3 million) between Jan’22 & Feb’23. 24-hour composite samples were processed by Centricon ultracentrifugation, and RNA extracted. IAV, and RSV were quantified in duplicate by established RT-qPCR assays. WW SARS-CoV-2 level values adjusted by population served by each WWTP were compared with clinical cases in sewershed-matched areas in Edmonton Health Zone. Daily IAV and RSV case numbers were generated from IAV and RSV specimen testing data extracted from Alberta Precision Laboratory-Public Health Laboratory and FSA of the specimens was used to create the sewershed-matched case data. Results A total of 361 wastewater samples from the two WWTPs were collected between January 2022 and February 2023: 83 (30%) tested positive for IAV and 185 (51.2%) for RSV. Over two respiratory viral seasons, 2021/2022 and 2022/2023, IAV peaked in May/June 2022 and again in Nov/Dec 2022. IAV and RSV measured in WW positively correlated with daily confirmed clinical cases within the Edmonton Health Zone (Pearson correlation IAV, r2=0.61, p< 0.0001; RSV, r2=0.65, p< 0.0001). Relative to the 2021/2022 season, the WW RSV peak in the 2022/2023 season occurring in November/January was much greater. Figure 1 Population normalized Flu A concentrations in wastewater vs. population normalized case rates in the Edmonton Health Zone. Figure 2 Population normalized RSV concentrations in wastewater vs. population normalized case rates in the Edmonton Health Zone. Conclusion WBS of IAV and RSV demonstrated strong correlations with clinically confirmed diseases in sewershed-matched areas in Edmonton, Alberta. WBS enables objective, inclusive and unbiased monitoring of endemic respiratory viral disease activity. Disclosures All Authors: No reported disclosures
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».