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Enregistrement W4389029728 · doi:10.1093/ofid/ofad500.1544

1711. Prospective Environmental Surveillance of Floors in a Pediatric Emergency Department During a Respiratory Syncytial Virus Surge in Ottawa, Canada

2023· article· en· W4389029728 sur OpenAlexaffabout
Nisha Thampi, Jason Moggridge, Engluy Khov, Aaron Hinz, Lucas Castellani, Evgueni Doukhanine, Laura Hug, Rees Kassen, Derek R. MacFadden, Caroline Nott, Alex Wong, Michael Fralick

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensOttawa HospitalCarleton UniversityUniversity of WaterlooUniversity of OttawaSault Area HospitalMount Sinai HospitalUniversity of TorontoAgricultural Research Institute of Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineEmergency departmentProspective cohort studyOutbreakPopulationEmergency medicineTriageViral loadPediatricsVirologyInternal medicineVirusEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Annual respiratory syncytial virus (RSV) epidemics disproportionately impact infants and young children. Clinical surveillance is often restricted to laboratory-confirmed hospitalizations. Built environmental surveillance through floor sampling may provide population-level insights into RSV transmission dynamics and inform public health action to blunt community outbreaks.Figure:Quantification of viral detection from floor swabs in the pediatric emergency department by multiplex PCR Each point represents the number of viral copies, plus one, detected from a swab captured at a given location (y-axis) on a given date (x-axis). A value of one copy indicates non-detection of RSV. Methods A prospective environmental surveillance study was conducted in Ottawa, Canada from November 24, 2022 to March 24, 2023. Floors were swabbed in six areas of the emergency department (ED) of the sole pediatric acute care facility in Eastern Ontario. Samples were tested for RSV by a validated multiplex PCR assay. Floor swab positivity was compared to hospitalization data of patients with laboratory-confirmed RSV using Pearson’s correlation analysis to determine the degree of their association. Results Over an 18-week period, 432 floor swabs were collected in the ED and 250 pediatric patients were hospitalized. RSV was detected in 65% of floor swabs, with more viral copies detected in congregate areas (waiting rooms, triage) (Figure). The correlation between swab positivity and RSV hospitalizations was 0.64 (95%CI 0.23-0.86). Conclusion RSV was frequently detected on floors in the hospital-built environment and correlated somewhat with hospitalizations, likely reflecting community viral prevalence rather than severe RSV disease. Having real-time floor signals in different areas of the ED allowed for spatial resolution of the signal intensity, identifying higher RSV burden in areas where patients with infectious symptoms were more likely to congregate for prolonged periods of time. Floor sampling may be useful in developing spatially-refined approaches to infection prevention and control measures, particularly in indoor areas with increased respiratory viral transmission risks. Disclosures Evgueni Doukhanine, MSc, DNA Genotek: DNA Genotek provided sampling swabs in-kind for this study in an unrestricted fashion. Michael Fralick, MD, ProofDx: Advisor/Consultant

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,562
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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