2641. Nirsevimab binding-site conservation in RSV F protein between 2015 and 2022: The US OUTSMART-RSV surveillance study
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Nirsevimab is an extended half-life monoclonal antibody that binds the prefusion conformation of RSV fusion (F) protein and has been approved for the prevention of respiratory syncytial virus (RSV) lower respiratory tract disease in neonates and infants in the EU, Great Britain, and Canada. Global surveillance studies found that the nirsevimab binding site was highly conserved across RSV variants between 1956–2021. While RSV B F protein binding site substitutions I206M and Q209R have dominated since the 2017/2018 RSV season, both remain fully susceptible to nirsevimab. OUTSMART-RSV is a multi-year (from 2015) prospective molecular surveillance study to monitor the prevalence and distribution of RSV variants in the USA and track the emergence and susceptibility of RSV F variants to nirsevimab. Methods Nasal swabs were collected from infants and adults seeking medical attention for respiratory infection (inpatient or outpatient); RSV-positive isolates underwent next generation sequencing. Subtyping comprised analysis of the hypervariable region of the G protein. F protein polymorphisms were identified by comparing with RSV A and B reference sequences; variants with increasing prevalence were phenotypically evaluated using reverse genetics rescue and in vitro microneutralization assays. Results RSV A and B subtypes circulated with alternate frequency during OUTSMART-RSV (Figure 1), with RSV B dominant in the 2021/2022 RSV season (sequence count 509 vs 46 for RSV A; Table 1). From 2020, several additional RSV B F protein substitutions have increased in prevalence, including the S211N binding site substitution. Importantly, S211N retains full susceptibility to nirsevimab (IC50 fold change = 1.24 vs reference). Also, no new nirsevimab binding site substitutions were seen in the 2021/2022 RSV season vs previous seasons. Conclusion While I206M and Q209R substitutions in RSV B F protein continue to dominate, the S211N nirsevimab binding site substitution has increased in prevalence since the 2020-2021 season. However, similar to I206M and Q209R, S211N variants remain fully susceptible to nirsevimab. Among recent circulating RSV strains, the frequency of emergent nirsevimab escape variants continue to be rare and not persistent. Disclosures Christopher A. Morehouse, MS, AstraZeneca: Employee|AstraZeneca: Stocks/Bonds Bahar Ahani, BSC, AstraZeneca: Employee|AstraZeneca: Stocks/Bonds Anastasia A. Aksyuk, PhD, AstraZeneca: Employee|AstraZeneca: Stocks/Bonds Tyler Brady, MS, AstraZeneca: Employee|AstraZeneca: Stocks/Bonds Kevin M. Tuffy, MS, AstraZeneca: Employee|AstraZeneca: Stocks/Bonds Hong Ji, MS, AstraZeneca: Employee|AstraZeneca: Stocks/Bonds Elizabeth J. Kelly, PhD, AstraZeneca: Employee|AstraZeneca: Stocks/Bonds Deidre Wilkins, BSC, AstraZeneca: Employee|AstraZeneca: Stocks/Bonds
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».