MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4389030328 · doi:10.1093/ofid/ofad500.2247

2635. Introduction of point-of-care testing for respiratory viruses in congregate living facilities

2023· article· en· W4389030328 sur OpenAlexaffabout
Charlie Tan, Marianna Ofner, J.A. O’Brien, Christina K. Chan, Robert Kozak, Neethu Thomas, Heather Candon, Adrienne K Chan, Jerome A. Leis

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOutbreakPoint-of-care testingInfection controlGold standard (test)Emergency medicinePoint of careRespiratory systemMultiplexVirologyInternal medicineIntensive care medicineImmunologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Timely diagnosis of viral respiratory infection is critical to control respiratory viral transmission in congregate care facilities. We conducted a quality improvement study to assess whether a point-of-care (POC) testing for detection of respiratory viruses could improve time to outbreak measures in congregate living facilities. Methods We implemented a POC cartridge based nucleic acid amplification test platform, which detects SARS-CoV-2, influenza A, and respiratory syncytial virus, at one long-term care home and three retirement homes between December 1, 2022 and April 15, 2023. Residents with respiratory symptoms underwent paired testing, whereby nasopharyngeal swabs were tested first on POC, then on multiplex respiratory virus panel (MRVP) polymerase chain reaction at an external laboratory. We determined difference in turn-around time (TAT), as well as sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV), using MRVP as the reference standard. We also compared time to outbreak declaration (from MRVP result) to five other congregate care facilities without access to POC testing. Results A total of 189 tests were performed using POC testing, of which 39.7% (75/189) were positive. SARS-CoV-2 was the most common virus identified (90.7%, 68/75). Median difference in TAT between POC and MRVP was 34.0 hours (IQR 21.8–43.5 hours). Sensitivity, specificity, PPV and NPV of POC were 0.88, 0.87, 0.83 and 0.90, respectively. There were six outbreaks during the study period (all SARS-CoV-2), of which two were declared based on POC result alone, before MRVP was resulted. Median time to outbreak declaration from MRVP result for the remaining four outbreaks was 6.6 hours (IQR 4.6–9.2 hours). In comparison, there were nine outbreaks at the non-POC comparator facilities; median time to outbreak declaration was 15.2 hours (IQR 5.5–26.0 hours). Conclusion We demonstrated the feasibility of implementing a POC platform in congregate living facilities for identification of respiratory viral infection. The improved TAT resulted in more expedited detection and declaration of outbreaks. Disclosures Jerome A. Leis, MD MSc FRCPC, Ontario Hospital Association, Ministry of Attorney General of Ontario, Seneca College: Expert Testimony

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,116
Score d'incertitude au seuil0,818

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,383
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueOpen Forum Infectious DiseasesMême sujetRespiratory viral infections researchTravaux en français237 207