2307. Respiratory Virus Testing Strategy on Admission to Hospital in a Season where SARS-CoV-2 is Co-circulating with Seasonal Respiratory Viruses
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Syndromic multiplex testing is the mainstay of viral respiratory surveillance, yet some evidence supports the use of asymptomatic testing for SARS-CoV-2 on patient admission. We conducted a prospective quality improvement study to determine the adherence and outcomes associated with a hybrid surveillance strategy for patients being admitted to an acute care hospital who underwent testing on admission. Methods In November, 2022, corporate education recommended that patients with compatible viral respiratory symptoms undergo respiratory multiplex testing for 15 viral pathogens, while those without viral respiratory symptoms (considered asymptomatic) undergo SARS-CoV-2 PCR testing alone. Between December 1, 2022 to March 30, 2023, we measured the testing strategy using positivity rate, rate of omission (i.e., SARS-CoV-2 testing for symptomatic patients, defined as needing a repeat swab for multiplex within 24-hours of admission), and rate of commission (i.e., multiplex testing for asymptomatic patients). Those with detection of non-SARS-CoV-2 respiratory viruses in absence of symptoms were prospectively assessed for 24 hours for development of symptoms and roommate contacts underwent syndromic surveillance for 72-hours. Results Among 5659 patients tested on admission, 2868(50.6%) underwent multiplex testing while 2791(49.3%) were tested only for SARS-CoV-2. The positivity rate for multiplex testing, positivity rate for COVID SARS-CoV-2 testing, omission rate and commission rate were 249/2868(8.7%), 81/2791 (2.9%), 259/1403(17.8%), 1618/4091(39.6%), respectively. Symptom status for 165 patients was not available. Asymptomatic non-SARS-CoV-2 positive patients made up 0.6% of all admissions, of whom none developed symptoms within 24 hours, and the attack rate among roommate contacts was zero (0/20). There were only 31 additional days of precautions for asymptomatic non-SARS-CoV-2 respiratory virus detection that made up 4.4% of overall precaution-days for respiratory virus infection. Conclusion A hybrid surveillance strategy for patients admitted to hospital based on presence of symptoms was implemented with relatively low rates of repeat testing and asymptomatic non-SARS-CoV-2 virus detection. Disclosures Jerome A. Leis, MD MSc FRCPC, Ontario Hospital Association, Ministry of Attorney General of Ontario, Seneca College: Expert Testimony
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».