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Enregistrement W4389031752 · doi:10.1093/ofid/ofad500.1929

2307. Respiratory Virus Testing Strategy on Admission to Hospital in a Season where SARS-CoV-2 is Co-circulating with Seasonal Respiratory Viruses

2023· article· en· W4389031752 sur OpenAlexaffabout
Paige Reason, Victoria R. Williams, Lorraine Maze Dit Mieusement, Heather Candon, Xena X. Li, Robert Kozak, Jerome A. Leis

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineAsymptomaticRespiratory systemMultiplexAsymptomatic carrierSevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Prospective cohort studyRespiratory rateMultiplex polymerase chain reactionCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Internal medicineEmergency medicineIntensive care medicinePediatricsHeart rateDiseasePolymerase chain reactionBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Syndromic multiplex testing is the mainstay of viral respiratory surveillance, yet some evidence supports the use of asymptomatic testing for SARS-CoV-2 on patient admission. We conducted a prospective quality improvement study to determine the adherence and outcomes associated with a hybrid surveillance strategy for patients being admitted to an acute care hospital who underwent testing on admission. Methods In November, 2022, corporate education recommended that patients with compatible viral respiratory symptoms undergo respiratory multiplex testing for 15 viral pathogens, while those without viral respiratory symptoms (considered asymptomatic) undergo SARS-CoV-2 PCR testing alone. Between December 1, 2022 to March 30, 2023, we measured the testing strategy using positivity rate, rate of omission (i.e., SARS-CoV-2 testing for symptomatic patients, defined as needing a repeat swab for multiplex within 24-hours of admission), and rate of commission (i.e., multiplex testing for asymptomatic patients). Those with detection of non-SARS-CoV-2 respiratory viruses in absence of symptoms were prospectively assessed for 24 hours for development of symptoms and roommate contacts underwent syndromic surveillance for 72-hours. Results Among 5659 patients tested on admission, 2868(50.6%) underwent multiplex testing while 2791(49.3%) were tested only for SARS-CoV-2. The positivity rate for multiplex testing, positivity rate for COVID SARS-CoV-2 testing, omission rate and commission rate were 249/2868(8.7%), 81/2791 (2.9%), 259/1403(17.8%), 1618/4091(39.6%), respectively. Symptom status for 165 patients was not available. Asymptomatic non-SARS-CoV-2 positive patients made up 0.6% of all admissions, of whom none developed symptoms within 24 hours, and the attack rate among roommate contacts was zero (0/20). There were only 31 additional days of precautions for asymptomatic non-SARS-CoV-2 respiratory virus detection that made up 4.4% of overall precaution-days for respiratory virus infection. Conclusion A hybrid surveillance strategy for patients admitted to hospital based on presence of symptoms was implemented with relatively low rates of repeat testing and asymptomatic non-SARS-CoV-2 virus detection. Disclosures Jerome A. Leis, MD MSc FRCPC, Ontario Hospital Association, Ministry of Attorney General of Ontario, Seneca College: Expert Testimony

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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