MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4389034144 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.lb63

Study of the Role of Moonlighting Proteins: TrappC12 in Membrane Trafficking and Mitosis and TrappC11 in Golgi Integrity and ER‐to‐Golgi Trafficking

2016· article· en· W4389034144 sur OpenAlexaffabout
Keshika Prematilake, Michael Sacher

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensMcGill UniversityConcordia University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyMitosisGolgi apparatusBiologyMotor proteinTransport proteinSecretory pathwayNocodazoleChemistryCellMicrotubuleBiochemistryCytoskeletonEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Membrane trafficking is the transport of cargo proteins from one compartment to another through vesicle budding. In eukaryotic cells, vesicle trafficking requires multiple tethering complexes, including TRAPP (TRAnsport Protein Particle) complexes to regulate tethering and fusion of vesicles to membranes. TRAPP complexes consist of core subunits and non‐obligate subunits which are associated with heterogeneous diseases, including myopathies such as Limb‐Girdle Muscular Dystrophy (LGMB). A novel and non‐obligate subunit of human TRAPP complex III, TrappC12, has been identified as a “moonlighting” protein due to its function in mitosis and its association with TRAPP III. Another TRAPP III specific subunit, TrappC11, has also been identified to play a role in the formation of Golgi. In this study, we investigated whether TrappC12 play a direct role in the early secretory pathway and mitosis and whether TrappC11 play a direct role in Golgi fragmentation and the early secretory pathway. To isolate functions of TrappC12 in membrane trafficking and mitosis, we employed a novel and rapid gene silencing method, “knocksideways”, to investigate the immediate effects of inactivating TrappC12 in non‐synchronized cells. We observed TrappC12 was localized away from its functional location in HeLa cells within 20 minutes of knocksideways treatment. The recruitment of TrappC12 away from its site of action arrested HeLa cell line stably expressing TrappC12 at metaphase. Quantification of the effect of knocksideways showed an increase in the number of mitotic cells from (7.7±1.0) % for non‐treated cells to (19.9±3.1) % for knocksideways applied to transfected TrappC12 upon knockdown of endogenous TrappC12. Study of the membrane trafficking function of TrappC12 using knocksideways applied to a membrane trafficking assay, vesicular stomatitis virus glycoprotein (VSV‐G) assay, showed no delay in ER‐to‐Golgi trafficking in western blot. Since TrappC12 does not play a role in the early secretory pathway, further experiments are required to determine TrappC12 function in the late secretory pathway, including intra‐Golgi trafficking, autophagy and Golgi‐to‐plasma membrane trafficking. Golgi compartment changes its morphology during cell cycle to undergo fragmentation during mitosis. The mechanism of how Golgi returns to its normal form could be related to functions of TrappC11. We applied VSV‐G assay to cells upon knockdown of endogenous TrappC11 and cells with mutant variants of TrappC11 and observed a significant delay in ER‐to‐Golgi trafficking and/or fragmented Golgi in western blot analysis, live‐cell imaging, and immunofluorescence. Further experiments are required to determine the distinct role of TrappC11 in ER‐to‐Golgi trafficking and formation of Golgi. These identifications of the possible functions of TrappC12 and TrappC11 can lead to the discovery of potential targets for development of therapeutics for musculoskeletal diseases and intellectual disabilities including LGMB and various myopathies. Support or Funding Information Dr. Michael Sacher's laboratory is funded by CIHR (Canadian Institutes of Health Research), NSERC (Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada) and CFI (Canada Foundation for Innovation). Dr. Michael Sacher is a member of GRASP (Groupe de Recherche Axé sur la Structure des Protéines).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetCellular transport and secretion→Travaux en français237 207→