A Genome‐Wide Association Study of Plasma α <sub>2</sub> ‐Macroglobulin Concentrations in Young Adults
Notice bibliographique
Résumé
Background Gluten intake has been shown to be associated with circulating levels of α 2 ‐macroglobulin in young adults without celiac disease. Gluten‐free foods have increased in popularity over the past decade despite a poor understanding of the physiological effects of gluten intake in those without celiac disease. Plasma α 2 ‐macroglobulin represents a physiologically important molecule involved in inflammation and cytokine release, but the contribution of common genetic variation to the observed variation in circulating concentrations of α 2 ‐macroglobulin remains unclear. Objective The objective was to identify genetic variants that are associated with α 2 ‐macroglobulin in a population of young adults using a genome‐wide approach. Methods A genome‐wide association study (GWAS) was conducted on circulating levels of α 2 ‐macroglobulin in a population of young Caucasians without clinically diagnosed celiac disease from the Toronto Nutrigenomics and Health Study (n=488). Concentrations of α 2 ‐macroglobulin were measured in plasma using a multiple reaction monitoring HPLC‐MS/MS assay. Genome‐wide genotyping was conducted for 822,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs) using the Affymetrix 6.0 chip. The association between genome‐wide genetic variants and plasma α 2 ‐macroglobulin was explored using linear regression with an additive mode of inheritance. Results Circulating α 2 ‐macroglobulin was associated with variation in ICOSGL (p = 3.9×10 −7 ), a T‐cell stimulatory gene involved in cytokine release and various immune‐related disorders including celiac disease. Conclusion These results suggest that the physiological effects of gluten intake may be mediated by genes involved in T‐cell proliferation and cytokine release. Support or Funding Information Research support from the Advanced Foods and Materials Network.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».