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Enregistrement W4389034991 · doi:10.1096/fasebj.30.1_supplement.127.3

A Genome‐Wide Association Study of Plasma α <sub>2</sub> ‐Macroglobulin Concentrations in Young Adults

2016· article· en· W4389034991 sur OpenAlexafffundabout
Joseph Jamnik, Christoph H. Borchers, Ahmed El‐Sohemy

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCeliac Disease Research and Management
Établissements canadiensGenome British ColumbiaUniversity of VictoriaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesAdvanced Foods and Materials Network
Mots-clésGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismGlutenMacroglobulinPopulationGenotypingGenetic associationDiseaseBiologyImmunologyMedicineGeneticsGeneInternal medicineGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Gluten intake has been shown to be associated with circulating levels of α 2 ‐macroglobulin in young adults without celiac disease. Gluten‐free foods have increased in popularity over the past decade despite a poor understanding of the physiological effects of gluten intake in those without celiac disease. Plasma α 2 ‐macroglobulin represents a physiologically important molecule involved in inflammation and cytokine release, but the contribution of common genetic variation to the observed variation in circulating concentrations of α 2 ‐macroglobulin remains unclear. Objective The objective was to identify genetic variants that are associated with α 2 ‐macroglobulin in a population of young adults using a genome‐wide approach. Methods A genome‐wide association study (GWAS) was conducted on circulating levels of α 2 ‐macroglobulin in a population of young Caucasians without clinically diagnosed celiac disease from the Toronto Nutrigenomics and Health Study (n=488). Concentrations of α 2 ‐macroglobulin were measured in plasma using a multiple reaction monitoring HPLC‐MS/MS assay. Genome‐wide genotyping was conducted for 822,000 single nucleotide polymorphisms (SNPs) using the Affymetrix 6.0 chip. The association between genome‐wide genetic variants and plasma α 2 ‐macroglobulin was explored using linear regression with an additive mode of inheritance. Results Circulating α 2 ‐macroglobulin was associated with variation in ICOSGL (p = 3.9×10 −7 ), a T‐cell stimulatory gene involved in cytokine release and various immune‐related disorders including celiac disease. Conclusion These results suggest that the physiological effects of gluten intake may be mediated by genes involved in T‐cell proliferation and cytokine release. Support or Funding Information Research support from the Advanced Foods and Materials Network.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,058

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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