STAT5B germline heterozygous variant presenting with lymphadenopathy, atopy, and short stature
Notice bibliographique
Résumé
Background: Signal Transducers and Activators of Transcription (STAT) proteins are fundamental for multiple cellular processes, including immunity. STAT5B serves as a signal transducer downstream of cytokine and growth factor-mediated activation. Aberrations in STAT5B are associated with the development of atopy, immunodeficiencies, autoimmunity, cancers, hematological disease, growth disorders, and lung disease. Biallelic STAT5B variants are associated with loss-of-function of the gene, and cause a recessive disorder characterized by growth hormone insensitivity and immune dysregulation. Clinically significant heterozygous variants result in either dominant negative or gain-of-function effects; these latter variants are rare and their impact on the immune system is less clearly delineated than those responsible for the recessive form of the condition. Aim: We describe the presentation, immune workup, and genetic findings in a pediatric patient with a novel STAT5B heterozygous variant. Methods: A thorough retrospective review of the patient’s chart was performed. Results: A four-year-old male presented with history of lymphadenopathy, eczema, asthma, food allergy, short stature, and recurrent upper and lower respiratory tract infections. Clinical trio whole exome sequencing identified a novel heterozygous variant (c.1A>G; p. Met1?) in STAT5B. His mother harbours the same heterozygous variant and has a history remarkable for atopy. Immune investigations on the child revealed persistent elevated IgE. The patient’s variant targets the STAT5B N-terminal domain, and represents the first case with a heterozygous variant affecting this region. Conclusion: We present a novel STAT5B variant associated with a dominantly-inherited growth and immune phenotype. This is the first report of a heterozygous variant affecting the N-terminal domain in association with a clinical phenotype, expanding the genotypic landscape of this disorder. Further investigations and follow up responses to growth hormone replacement are needed to better delineate the functional effect of the variant identified in this family. Statement of Novelty: We report a novel germline heterozygous STAT5B variant in a paediatric patient with lymphadenopathy, atopy, and short stature.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».