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Enregistrement W4389040648 · doi:10.1182/bloodadvances.2023010882

<i>JAK2</i> <i>V617F</i> mutation and associated chromosomal alterations in primary and secondary myelofibrosis and post-HCT outcomes

2023· article· en· W4389040648 sur OpenAlexaff
Maryam Rafati, Derek W. Brown, Weiyin Zhou, Kristine Jones, Wen Luo, Andrew St. Martin, Youjin Wang, Meilun He, Stephen R. Spellman, Tao Wang, H. Joachim Deeg, Vikas Gupta, Stephanie J. Lee, Yung‐Tsi Bolon, Stephen J. Chanock, Mitchell J. Machiela, Wael Saber, Shahinaz M. Gadalla

Notice bibliographique

RevueBlood Advances · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMyeloproliferative Neoplasms: Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteDivision of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer InstituteOffice of Naval ResearchHealth Resources and Services AdministrationNational Cancer InstituteU.S. Department of Health and Human ServicesNational Institutes of HealthBe The Match Foundation
Mots-clésHazard ratioMedicineMyelofibrosisInternal medicineGenotypingTransplantationInternational Prognostic Scoring SystemOncologyHematopoietic stem cell transplantationConfidence intervalGastroenterologyBone marrowGenotypeGeneticsMyelodysplastic syndromesBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

JAK2 V617F is the most common driver mutation in primary or secondary myelofibrosis for which allogeneic hematopoietic cell transplantation (HCT) is the only curative treatment. Knowledge of the prognostic utility of JAK2 alterations in the HCT setting is limited. We identified all patients with MF who received HCT between 2000 and 2016 and had a pre-HCT blood sample (N = 973) available at the Center of International Blood and Marrow Transplant Research biorepository. PacBio sequencing and single nucleotide polymorphism-array genotyping were used to identify JAK2V617F mutation and associated mosaic chromosomal alterations (mCAs), respectively. Cox proportional hazard models were used for HCT outcome analyses. Genomic testing was complete for 924 patients with MF (634 primary MF [PMF], 135 postpolycythemia vera [PPV-MF], and 155 postessential thrombocytopenia [PET-MF]). JAK2V617F affected 562 patients (57.6% of PMF, 97% of PPV-MF, and 42.6% of PET-MF). Almost all patients with mCAs involving the JAK2 region (97.9%) were JAK2V617-positive. In PMF, JAK2V617F mutation status, allele burden, or identified mCAs were not associated with disease progression/relapse, nonrelapse mortality (NRM), or overall survival. Almost all PPV-MF were JAK2V617F-positive (97%), with no association between HCT outcomes and mutation allele burden or mCAs. In PET-MF, JAK2V617F high mutation allele burden (≥60%) was associated with excess risk of NRM, restricted to transplants received in the era of JAK inhibitors (2013-2016; hazard ratio = 7.65; 95% confidence interval = 2.10-27.82; P = .002). However, allele burden was not associated with post-HCT disease progression/relapse or survival. Our findings support the concept that HCT can mitigate the known negative effect of JAK2V617F in patients with MF, particularly for PMF and PPV-MF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,620

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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