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Enregistrement W4389061858 · doi:10.1200/cci.23.00116

Evaluating the Utility and Privacy of Synthetic Breast Cancer Clinical Trial Data Sets

2023· article· en· W4389061858 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJCO Clinical Cancer Informatics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiquePrivacy-Preserving Technologies in Data
Établissements canadiensQueen's UniversityMcMaster UniversityAlberta Health ServicesOttawa HospitalUniversity of OttawaAgricultural Research Institute of Ontario
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of Ontario
Mots-clésComputer scienceSynthetic dataData sharingGenerative modelClinical trialData miningData typeBreast cancerMachine learningArtificial intelligenceGenerative grammarMedicineCancerAlternative medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: There is strong interest from patients, researchers, the pharmaceutical industry, medical journal editors, funders of research, and regulators in sharing clinical trial data for secondary analysis. However, data access remains a challenge because of concerns about patient privacy. It has been argued that synthetic data generation (SDG) is an effective way to address these privacy concerns. There is a dearth of evidence supporting this on oncology clinical trial data sets, and on the utility of privacy-preserving synthetic data. The objective of the proposed study is to validate the utility and privacy risks of synthetic clinical trial data sets across multiple SDG techniques. METHODS: We synthesized data sets from eight breast cancer clinical trial data sets using three types of generative models: sequential synthesis, conditional generative adversarial network, and variational autoencoder. Synthetic data utility was evaluated by replicating the published analyses on the synthetic data and assessing concordance of effect estimates and CIs between real and synthetic data. Privacy was evaluated by measuring attribution disclosure risk and membership disclosure risk. RESULTS: Utility was highest using the sequential synthesis method where all results were replicable and the CI overlap most similar or higher for seven of eight data sets. Both types of privacy risks were low across all three types of generative models. DISCUSSION: Synthetic data using sequential synthesis methods can act as a proxy for real clinical trial data sets, and simultaneously have low privacy risks. This type of generative model can be one way to enable broader sharing of clinical trial data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,076
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesScience ouverte
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,927
Score d'incertitude au seuil0,974

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,076
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0310,115
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,505
Tête enseignante GPT0,552
Écart entre enseignants0,047 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle