Circulating Oncometabolite 2-hydroxyglutarate as a Potential Biomarker for Isocitrate Dehydrogenase (<i>IDH1/2</i>) Mutant Cholangiocarcinoma
Notice bibliographique
Résumé
Isocitrate dehydrogenase (IDH) enzymes catalyze the decarboxylation of isocitrate to alpha-ketoglutarate (αKG). IDH1/2 mutations preferentially convert αKG to R-2-hydroxyglutarate (R2HG), resulting in R2HG accumulation in tumor tissues. We investigated circulating 2-hydroxyglutate (2HG) as potential biomarkers for patients with IDH-mutant (IDHmt) cholangiocarcinoma (CCA). R2HG and S-2-hydroxyglutarate (S2HG) levels in blood and tumor tissues were analyzed in a discovery cohort of patients with IDHmt glioma and CCA. Results were validated in cohorts of patients with CCA and clear-cell renal cell carcinoma. The R2HG/S2HG ratio (rRS) was significantly elevated in tumor tissues, but not in blood for patients with IDHmt glioma, while circulating rRS was elevated in patients with IDHmt CCA. There were overlap distributions of circulating R2HG and total 2HG in patients with both IDHmt and wild-type (IDHwt) CCA, while there was minimal overlap in rRS values between patients with IDHmt and IDHwt CCA. Using the rRS cut-off value of 1.5, the sensitivity of rRS was 90% and specificity was 96.8%. Circulating rRS is significantly increased in patients with IDHmt CCA compare with patients with IDHwt CCA. Circulating rRS is a sensitive and specific surrogate biomarker for IDH1/2 mutations in CCA. It can potentially be used as a tool for monitoring IDH-targeted therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».