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Enregistrement W4389086927 · doi:10.2196/50379

Generating Contextual Variables From Web-Based Data for Health Research: Tutorial on Web Scraping, Text Mining, and Spatial Overlay Analysis

2023· article· en· W4389086927 sur OpenAlexaffvenue
Pablo Gálvez-Hernández, Angelina Gónzalez-Viana, Luis González‐de Paz, Ketan Shankardass

Notice bibliographique

RevueJMIR Public Health and Surveillance · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueData-Driven Disease Surveillance
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversitySt. Michael's HospitalPublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer sciencePreprintPython (programming language)Data miningWorld Wide WebData scienceInformation retrieval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Contextual variables that capture the characteristics of delimited geographic or jurisdictional areas are vital for health and social research. However, obtaining data sets with contextual-level data can be challenging in the absence of monitoring systems or public census data. OBJECTIVE: We describe and implement an 8-step method that combines web scraping, text mining, and spatial overlay analysis (WeTMS) to transform extensive text data from government websites into analyzable data sets containing contextual data for jurisdictional areas. METHODS: This tutorial describes the method and provides resources for its application by health and social researchers. We used this method to create data sets of health assets aimed at enhancing older adults' social connections (eg, activities and resources such as walking groups and senior clubs) across the 374 health jurisdictions in Catalonia from 2015 to 2022. These assets are registered on a web-based government platform by local stakeholders from various health and nonhealth organizations as part of a national public health program. Steps 1 to 3 involved defining the variables of interest, identifying data sources, and using Python to extract information from 50,000 websites linked to the platform. Steps 4 to 6 comprised preprocessing the scraped text, defining new variables to classify health assets based on social connection constructs, analyzing word frequencies in titles and descriptions of the assets, creating topic-specific dictionaries, implementing a rule-based classifier in R, and verifying the results. Steps 7 and 8 integrate the spatial overlay analysis to determine the geographic location of each asset. We conducted a descriptive analysis of the data sets to report the characteristics of the assets identified and the patterns of asset registrations across areas. RESULTS: We identified and extracted data from 17,305 websites describing health assets. The titles and descriptions of the activities and resources contained 12,560 and 7301 unique words, respectively. After applying our classifier and spatial analysis algorithm, we generated 2 data sets containing 9546 health assets (5022 activities and 4524 resources) with the potential to enhance social connections among older adults. Stakeholders from 318 health jurisdictions registered identified assets on the platform between July 2015 and December 2022. The agreement rate between the classification algorithm and verified data sets ranged from 62.02% to 99.47% across variables. Leisure and skill development activities were the most prevalent (1844/5022, 36.72%). Leisure and cultural associations, such as social clubs for older adults, were the most common resources (878/4524, 19.41%). Health asset registration varied across areas, ranging between 0 and 263 activities and 0 and 265 resources. CONCLUSIONS: The sequential use of WeTMS offers a robust method for generating data sets containing contextual-level variables from internet text data. This study can guide health and social researchers in efficiently generating ready-to-analyze data sets containing contextual variables.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,249
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,165
Tête enseignante GPT0,415
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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