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Enregistrement W4389098583 · doi:10.1128/mbio.01791-23

Angucyclinones rescue PhLOPS <sub>A</sub> antibiotic activity by inhibiting Cfr-dependent antibiotic resistance

2023· article· en· W4389098583 sur OpenAlexafffund
Adam J. Schaenzer, Annia Rodríguez Hernández, Kaitlyn Tsai, Christian Hobson, Danica Galonić Fujimori, Gerard D. Wright

Notice bibliographique

RevuemBio · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA and protein synthesis mechanisms
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesGovernment of CanadaKeio UniversityNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMcMaster University
Mots-clésAntibioticsEscherichia coliMicrobiologyAntibiotic resistanceMethyltransferaseMethylationBiologyBacteriaStreptomycesBiochemistryGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Methylation of the ribosome is a prevalent strategy conferring resistance to antibiotics that inhibit protein synthesis. Methylation is catalyzed by several distinct enzymes, many encoded on mobile genetic elements widespread in bacteria. One enzyme that is increasingly common in Gram-positive pathogens is Cfr. This radical S-adenosyl-L-methionine rRNA methylase confers resistance to the antibiotics ph enicols, l incosamides, o xazolidinones, p leuromutilins, and s treptogramin A (PhLOPS A ) via methylation of A2503 of the 23S rRNA of the large ribosomal subunit. One strategy to safeguard the utility of these antibiotics is to identify inhibitors of Cfr-dependent methylation that may rescue antibiotic activity. We screened our in-house library of microbial natural product extracts against Cfr + Escherichia coli and identified an extract from Streptomyces WAC01849 that potentiated the PhLOPS A antibiotic linezolid in a Cfr-dependent manner. We isolated the active angucyclinones 8- O -methyltetrangomycin (MTN) and 8- O -methyltetrangulol (MTL) from this extract. Both compounds selectively potentiated representatives of the PhLOPS A antibiotics in Escherichia coli and methicillin-resistant Staphylococcus aureus in a Cfr-dependent manner. Finally, we observed inhibition of Cfr-mediated ribosome methylation in cells treated with MTN and MTL. Our findings suggest that MTN and MTL interfere with Cfr-dependent methylation to protect the efficacy of the PhLOPS A antibiotics and offer a unique chemical scaffold that may be applied in developing clinically useful Cfr inhibitors. IMPORTANCE Cfr is an antibiotic resistance enzyme that inhibits five clinically important antibiotic classes, is genetically mobile, and has a minimal fitness cost, making Cfr a serious threat to antibiotic efficacy. The significance of our work is in discovering molecules that inhibit Cfr-dependent methylation of the ribosome, thus protecting the efficacy of the PhLOPS A antibiotics. These molecules are the first reported inhibitors of Cfr-mediated ribosome methylation and, as such, will guide the further discovery of chemical scaffolds against Cfr-mediated antibiotic resistance. Our work acts as a foundation for further development of molecules that safeguard the PhLOPS A antibiotics from Cfr.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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