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Enregistrement W4389200714 · doi:10.3389/fnmol.2023.1242814

Characterization of a phenotypically severe animal model for human AB-Variant GM2 gangliosidosis

2023· article· en· W4389200714 sur OpenAlexafffund
Natalie M. Deschenes, Camilyn Cheng, Prem Khanal, Brianna M. Quinville, Alex E. Ryckman, Melissa Mitchell, Alexey V. Pshezhetsky, Jagdeep S. Walia

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Molecular Neuroscience · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineQueen's University
Organismes subventionnairesCanadian Glycomics Network
Mots-clésPhenotypeGangliosidosisNeurodegenerationAtaxiaBiologyPathologyNeuroscienceGeneticsMedicineGeneBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AB-Variant GM2 gangliosidosis (ABGM2) is a rare and lethal genetic disorder caused by mutations in the GM2A gene that lead to fatal accumulation of GM2 gangliosides (GM2) in neurons of the central nervous system (CNS). GM2A encodes a transport protein known as GM2 activator (GM2A) protein, which is essential for degrading GM2 into their GM3 form. ABGM2 presents in infantile-, juvenile-, and adult-onset forms; of the three, the infantile-onset is the most prominent, and by far the most severe, as evidenced by high levels of GM2 accumulation, widespread neurodegeneration, and death by the age of 4. Gm2a −/− mice are commonly used as a model of ABGM2. These mice are characterized by phenotypes most representative of predicted adult-onset form of ABGM2, which include moderate GM2 accumulation and mild neurological defects. This mild phenotype has been attributed to compensation by alternative GM2 degradation pathways mediated by sialidase, neuraminidase 3 (NEU3), a pathway that is more prominent in mice than humans. To assess the extent to which NEU3 contributes to GM2 degradation, we generated double knock-out ( Gm2a −/− Neu3 −/− ) mice. Compellingly, these mice present with a clinical phenotype resembling that of a more severe ABGM2, including ataxia, reduced mobility and coordination, weight loss, poor body scores, and lethality by 6–7 months. Furthermore, these phenotypes correlate with a dramatic increase in GM2 accumulation in the CNS compared to levels observed in either Gm2a −/− or Neu3 −/− mice. Taken together, these studies, for the first-time, confirm that the mild neurological phenotype of Gm2a −/− mice is due to compensatory activity on GM2 catabolism through an alternate breakdown pathway involving NEU3. These studies support the use of double knockout mice as a novel and highly relevant model for pre-clinical drug studies in a more severe form of ABGM2.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,295
Score d'incertitude au seuil0,489

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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