Global Malaise Trap Project and LIFEPLAN Malaise sampling v1
Notice bibliographique
Résumé
Lifeplan is a global biodiversity monitoring project with the aim of assessing the current state of biodiversity worldwide, and using this knowledge to generate predictions of how biodiversity might look in the future. In this protocol we describe the materials and method used to sample flying insects with a Malaise trap for the Global Malaise Trap Project and the LIFEPLAN project on a global scale and in a wide variety of environmental conditions and habitats. The aim is to identify species in further analysis (e.g. image recognition, DNA sequencing) and create species lists for different locations across the globe. This protocol contains a detailed description from setup of the Malaise traps in the field to weekly data collection, as well as steps to reduce ethanol in the samples and collect necessary information to help in species identification. We identify the equipment used in Lifeplan, but also give technical specifications of that equipment so that other users of this protocol can find equivalent alternative equipment. We also specify what metadata should be collected with the Malaise trap data. The technical solution we use to collect metadata in the Lifeplan project is described in detail in the full Lifeplan protocol. It is critical that we employ standardized operating procedures for the Malaise trapping. Our coordinated efforts will ensure specimen preservation for sequence analysis and high data quality, permitting the comparison of sites at a global scale. For global standardization with the BIOSCANinitiative, of which LIFEPLAN is a part. LIFEPLAN is based on bulk processing (metabarcoding) of samples and automatic image recognition which are outside of the scope of this protocol and will be described elsewhere.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,057 | 0,022 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».