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Enregistrement W4389235764 · doi:10.1016/j.stress.2023.100311

Low levels of flavonoids in Arabidopsis thaliana during phenanthrene exposure suggest new roles for a flavanone 3-hydroxylase

2023· article· en· W4389235764 sur OpenAlex
Juan C. Hernández-Vega, Tsering Gesar, Brian Cady, Gilbert Kayanja, Nik Kovinich, Merianne Alkio, Adán Colón‐Carmona

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePlant Stress · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesUniversity of Massachusetts BostonNational Science Foundation
Mots-clésFlavanoneFlavonoidPhenanthreneArabidopsis thalianaChemistryBiochemistryOxidative stressFlavonoid biosynthesisEnzymeMutantGeneAntioxidantEnvironmental chemistryGene expressionTranscriptome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) contamination impacts the well-being of fauna, flora, and the environment. PAHs are a group of compounds consisting of two or more benzene rings. Due to their structure, PAHs are very stable, generally non-reactive and resistant to biodegradation; yet these compounds are cytotoxic in biological systems. In plants, PAHs induce oxidative stress and cell death, and inhibit growth. Previous PAH exposure studies from our laboratory showed an up-regulation of the Arabidopsis thaliana gene At3g51240. At3g51240 encodes a flavanone 3-hydroxylase (F3H), an enzyme catalyzing the hydroxylation of flavanones, key intermediates in the flavonoid biosynthesis pathway. Considering that flavonoids may act as antioxidants and protect cells against oxidative stress, we hypothesized that F3H was important in alleviating PAH-induced stress symptoms. Analysis of flavonoid content by high performance liquid chromatography showed low levels of flavonoids in phenanthrene-treated plants. Analysis of At3g51240 loss-of-function mutant plant lines growing on phenanthrene-containing growth media showed reduced phenotypic stress responses. Interestingly, low levels of H2O2 were observed in the mutant plants, suggesting that this putative flavanone 3-hydroxylase may be involved in PAH oxidation, with the consequent H2O2 generation. Furthermore, in vitro assays with purified recombinant 6xHis tagged AT3G51240 showed enzyme activity on the PAH when phenanthrene was used as a substrate. Together, these data suggest that F3H is involved in PAH detoxification in planta with the subsequent accumulation of toxic metabolites. This research also indicates the potentiality of using specialized metabolism enzymes such as oxidoreductase in the genetic engineering of plants to remediate PAH-contaminated soils.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,555
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle