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Enregistrement W4389239845 · doi:10.1158/1535-7163.targ-23-c051

Abstract C051: Alteration of protein translation by eIF4A1 inhibition exquisitely primes lymphoma cells to induction of ferroptosis

2023· article· en· W4389239845 sur OpenAlexaff
Paola Manara, Alexa Marie Barroso, Abdessamad Youssfi Alaoui, Olivia Barbara Farag, Tyler A. Cunningham, Kyle Hoffman, Caroline A. Coughlin, Jonathan H. Schatz

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensBioinformatics Solutions (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscriptomeGPX4Cancer researchBiologyDiffuse large B-cell lymphomaCancer cellCell biologyLymphomaGlutathioneCancerGene expressionBiochemistryImmunologyGeneGlutathione peroxidaseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background: Ferroptosis induction as a cancer therapy faces challenges establishing clinical therapeutic windows. Cells employ diverse mechanisms to prevent iron-mediated oxidation of membrane polyunsaturated fatty acids that causes ferroptosis, but populations with low rates of protein synthesis such as hematopoietic stem cells are more susceptible. Therefore, we hypothesized protein synthesis inhibitors might enhance therapeutic ferroptosis induction. Rocaglates, inhibitors targeting eIF4A1, have entered clinical trials with promising potential against diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL), which also exhibits pre-clinical susceptibility to ferroptosis induction. Up to 40% of patients with DLBCL, the most common lymphoma type, have poor outcomes requiring new approaches to address these persistent unmet clinical needs. Our results reveal striking synergy of rocaglates, including the clinical compound zotatifin (eFT226), with ferroptosis inducers. TMT-pSILAC and RNA-seq analyses revealed profound deregulation of ferroptotic protection resulting from rocalate effects on protein synthesis. Methods: We used RNA-seq and TMT-pSILAC followed by mass spectrometry to analyze transcriptome and protein output in SU-DHL-10 DLBCL cells treated with zotatifin or DMSO for 24h. Enrichment analyses (Enrichr platform, ChIP-X Enrichment Analysis 3, GSEA) identified differentially expressed genes, proteins and transcription factors. We explored synergy between zotatifin and ferroptosis modulators in DLBCL cell lines and measured a wide variety of associated cellular endpoints including lipid peroxidation, glutathione levels, and glutathione peroxidase 4 (GPX4) expression. Results: TMT-pSILAC translatome assessment during rocaglate exposure revealed expression alteration(log2FC ≥ 1.5) of numerous key proteins involved in oxidative stress (i.e. SDHB, SDHA, TRAP1, SCO1, UQCRH, ETFA, COX7C) and enrichment of factors indicating induction of an antioxidant response (CD98HC, NRF1, ATF2, SP2, and NFE2L). These changes led to high synergy of zotatifin in combination with a wide variety of ferroptosis inducers (Bliss δ synergy score > 10) and antagonism with ferroptosis inhibitors (Bliss δ synergy score < - 10). These results were consistent across multiple DLBCL mouse and human experimental systems, and preliminarily appear present also in models of T-cell lymphomas. Lipid peroxidation levels were significantly enhanced when zotatifin was combined with erastin (p-value < 0.0005). Moreover, zotatifin treatment resulted in elevated levels of reduced glutathione (GSH), an effect overcome by addition of ferroptosis inducers (p-value < 0.005). Consistently, GPX4 expression was also impaired. Conclusions: Rocaglates induce novel alterations in oxidative stress factors and associated response pathways, sensitizing B and T lymphomas to therapeutic ferroptosis induction. These findings provide valuable insights for using rocaglates in combination with ferroptosis induction to overcome heterogeneous resistance pathways in high-risk lymphoma patients. Citation Format: Paola Manara, Alexa Marie Barroso, Abdessamad Youssfi Alaoui, Olivia Barbara Lightfuss, Tyler Andrew Cunningham, Kyle Hoffman, Caroline Alice Coughlin, Jonathan Harry Schatz. Alteration of protein translation by eIF4A1 inhibition exquisitely primes lymphoma cells to induction of ferroptosis [abstract]. In: Proceedings of the AACR-NCI-EORTC Virtual International Conference on Molecular Targets and Cancer Therapeutics; 2023 Oct 11-15; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2023;22(12 Suppl):Abstract nr C051.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,069
Score d'incertitude au seuil0,747

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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