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Enregistrement W4389273176 · doi:10.1101/2023.12.01.23299254

Dual T-cell constant β chain (TRBC)1 and TRBC2 staining for the identification of T-cell neoplasms by flow cytometry

2023· preprint· en· W4389273176 sur OpenAlexaff
Pedro Horna, Matthew J. Weybright, Mathieu Ferrari, Dennis Jungherz, YaYi Peng, Zulaikha Akbar, F. Tudor Ilca, Gregory E. Otteson, Jansen N. Seheult, Janosch Ortmann, Min Shi, Paul Maciocia, Marco Herling, Martin Pulé, Horatiu Olteanu

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCutaneous lymphoproliferative disorders research
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlow cytometryStainingT cellCellCD8Molecular biologyAntibodyMalignancyBiologyAntigenPathologyImmunologyMedicineImmune systemGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The diagnosis of leukemic T-cell malignancies is often challenging, due to overlapping features with reactive T-cells and limitations of currently available T-cell clonality assays. Recently developed therapeutic antibodies specific for the mutually exclusive T-cell receptor constant β chain (TRBC)1 and TRBC2 isoforms provide a unique opportunity to assess for TRBC-restriction as a surrogate of clonality in the flow cytometric analysis of T-cell neoplasms. To demonstrate the diagnostic utility of this approach, we studied 135 clinical specimens with (50) or without (85) T-cell neoplasia, in addition to 29 blood samples from healthy donors. Dual TRBC1 and TRBC2 expression was studied within a comprehensive T-cell panel, in a fashion similar to the routine evaluation of kappa and lambda immunoglobulin light chains for the detection of clonal B-cells. Polytypic TRBC expression was demonstrated on total, CD4 + and CD8 + T-cells from all healthy donors; and by intracellular staining on benign T-cell precursors. All neoplastic T-cells were TRBC-restricted, except for 5 cases (10%) lacking TRBC expression. T-cell clones of uncertain significance were identified in 15 samples without T-cell malignancy (13%), and accounted for smaller subsets than neoplastic clones (median: 4.7% vs. 73% of lymphocytes, p<0.0001). Single staining for TRBC1 produced spurious TRBC1-dim subsets in 21 clinical specimens (16%), all of which resolved with dual TRBC1/2 staining. Assessment of TRBC restriction by flow cytometry provides a rapid diagnostic method to detect clonal T-cells, and to accurately determine the targetable TRBC isoform expressed by T-cell malignancies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,315
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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