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Enregistrement W4389273781 · doi:10.14814/phy2.15870

Profiling of adenine‐derived signaling molecules, cytokinins, in myotubes reveals fluctuations in response to lipopolysaccharide‐induced cell stress

2023· article· en· W4389273781 sur OpenAlexafffund
Stephanie W. Tobin, Dev Seneviratne, Lorna N. Phan, Mark Seegobin, Alexander L. Rico, Beth Westby, Anna Kisiała, Sanela Martić, Craig R. Brunetti, R. J. Neil Emery

Notice bibliographique

RevuePhysiological Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueExercise and Physiological Responses
Établissements canadiensTrent University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaTrent UniversityYork University
Mots-clésMyogenesisCell biologyC2C12MyocyteExtracellularIntracellularSkeletal muscleBiologyCell signalingCellChemistryBiochemistrySignal transductionAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cytokinins (CTKs) are a diverse collection of evolutionarily conserved adenine-derived signaling molecules classically studied as phytohormones; however, their roles and production have been less studied in mammalian systems. Skeletal muscles are sensitive to cellular cues such as inflammation and in response, alter their secretome to regulate the muscle stem cell and myofiber niche. Using cultured C2C12 muscle cells, we profiled CTK levels to understand (1) whether CTKs are part of the muscle secretome and (2) whether CTKs are responsive to cellular stress. To induce cellular stress, C2C12 myotubes were treated with lipopolysaccharides (LPS) for 24 h and then media and cell fractions were collected for ultra high-performance liquid chromatography tandem mass spectrometry with electrospray ionization (UHPLC-(ESI+)-HRMS/MS) for metabolomics and CTK profiling. Across LPS-treated and control cells, 11 CTKs were detected in the extracellular space while 6 were detected intracellularly. We found that muscle cells are enriched in isopentenyladenine (iP) species (from free base, riboside to nucleotide forms), and that extracellular levels are increased after LPS treatment. Our study establishes that muscle cells express various forms of CTKs, and that CTK levels are responsive to LPS-induced cell stress, suggesting a role for CTKs in intra- and extracellular signaling of mammalian cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,431
Score d'incertitude au seuil0,837

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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