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Enregistrement W4389297538 · doi:10.1038/s41416-023-02511-8

Characterisation of FLT3 alterations in childhood acute lymphoblastic leukaemia

2023· article· en· W4389297538 sur OpenAlexafffund
Ángela Gutiérrez-Camino, Chantal Richer, Manon Ouimet, Claire Fuchs, Sylvie Langlois, Fida Khater, Maxime Caron, Patrick Beaulieu, Pascal St-Onge, Alain R. Bataille, Daniel Sinnett

Notice bibliographique

RevueBritish Journal of Cancer · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of Canada
Mots-clésMutationMedicineCancer researchMyeloidSorafenibTranscriptomePoint mutationMyeloid leukaemiaOncologyBioinformaticsInternal medicineBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Alterations of FLT3 are among the most common driver events in acute leukaemia with important clinical implications, since it allows patient classification into prognostic groups and the possibility of personalising therapy thanks to the availability of FLT3 inhibitors. Most of the knowledge on FLT3 implications comes from the study of acute myeloid leukaemia and so far, few studies have been performed in other leukaemias. METHODS: A comprehensive genomic (DNA-seq in 267 patients) and transcriptomic (RNA-seq in 160 patients) analysis of FLT3 in 342 childhood acute lymphoblastic leukaemia (ALL) patients was performed. Mutations were functionally characterised by in vitro experiments. RESULTS: Point mutations (PM) and internal tandem duplications (ITD) were detected in 4.3% and 2.7% of the patients, respectively. A new activating mutation of the TKD, G846D, conferred oncogenic properties and sorafenib resistance. Moreover, a novel alteration involving the circularisation of read-through transcripts (rt-circRNAs) was observed in 10% of the cases. Patients presenting FLT3 alterations exhibited higher levels of the receptor. In addition, patients with ZNF384- and MLL/KMT2A-rearranged ALL, as well as hyperdiploid subtype, overexpressed FLT3. DISCUSSION: Our results suggest that specific ALL subgroups may also benefit from a deeper understanding of the biology of FLT3 alterations and their clinical implications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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