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Enregistrement W4389315376 · doi:10.1128/spectrum.03130-23

<i>Lactococcus lactis</i> mutants resistant to lactococcin A and garvicin Q reveal missense mutations in the sugar transport domain of the mannose phosphotransferase system

2023· article· en· W4389315376 sur OpenAlexafffund
Marco J. van Belkum, Tamara Aleksandrzak‐Piekarczyk, Tess Lamer, John C. Vederas

Notice bibliographique

RevueMicrobiology Spectrum · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNarodowa Agencja Wymiany Akademickiej
Mots-clésPEP group translocationMissense mutationMannoseMutantPhosphotransferaseLactococcus lactisMutationGeneticsSugarBiologyBiochemistryGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Lactococcin A is a bacteriocin from Lactococcus lactis that permeabilizes the membrane of sensitive lactococcal cells and requires the presence of the membrane-bound components IIC and IID of the mannose phosphotransferase system (man-PTS). Recently, it was reported through cryo-electron microscopy analyses of man-PTS and several bacteriocins fused to a maltose-binding protein, including lactococcin A, that these bacteriocins create pores by inserting themselves between the Core and Vmotif domains of man-PTS. In our study, we obtained a dozen spontaneous mutants of L. lactis IL1403 resistant to lactococcin A. All but one of the mutants of IL1403 have mutations located in the genes encoding the IIC or IID proteins. These mutations also resulted in resistance to garvicin Q, a bacteriocin from Lactococcus garvieae with a broad inhibition spectrum and very little sequence homology to lactococcin A. Missense mutations were found in the sugar transport domain of man-PTS of bacteriocin-resistant IL1403 mutants, which also impeded the uptake of mannose. When lactococcin A, garvicin Q, or pediocin PA-1, an anti-listerial bacteriocin, were fused to a maltose-binding protein, we observed reduced or no antibacterial activity. Taken together, the precise mechanism of action of bacteriocins using the man-PTS remains to be fully understood. IMPORTANCE Many bacteriocins target the sugar transporter mannose phosphotransferase system (man-PTS) to exert their antibacterial activity. The elucidation in recent years of the structure of man-PTS has facilitated our understanding of how bacteriocins might interact with the receptor and which domains of the transporter are involved in bacteriocin resistance. Here, we show that missense mutations in the sugar-binding domain of the man-PTS not only impede the uptake of sugars but also prevent the antibacterial activity of the bacteriocins lactococcin A and garvicin Q.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,834
Score d'incertitude au seuil0,375

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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