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Enregistrement W4389322550 · doi:10.1101/2023.12.03.569760

Msx genes delineate a novel molecular map of the developing cerebellar neuroepithelium

2023· preprint· en· W4389322550 sur OpenAlexafffund
Ishita Gupta, Joanna Yeung, Maryam Rahimi-Balaei, Sih‐Rong Wu, Dan Goldowitz

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesRIKENNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBC Children's HospitalHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésHomeoboxBiologyGlutamatergicCerebellumDLX5Progenitor cellGeneNeuroepithelial cellCell biologyNeuroscienceAnatomyGeneticsGene expressionEmbryonic stem cellStem cellGlutamate receptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In the early cerebellar primordium, there are two progenitor zones, the ventricular zone (VZ) residing atop the IV th ventricle and the rhombic lip (RL) at the lateral edges of the developing cerebellum. These zones give rise to the several cell types that form the GABAergic and glutamatergic populations of the adult cerebellum, respectively. Recently, an understanding of the molecular compartmentation of these zones has emerged. The Msx genes are a family of three transcription factors that are expressed downstream of Bone Morphogenetic Protein (BMP) signaling in these zones. Using fluorescent RNA in situ hybridization, we have characterized the Msx (Msh Homeobox) genes and demonstrated that their spatiotemporal pattern segregates specific regions in the progenitor regions. Msx1 and Msx2 are compartmentalized within the rhombic lip (RL), while Msx3 is localized within the ventricular zone (VZ). The relationship of the Msx genes with an early marker of the glutamatergic lineage, Atoh1 , was examined in Atoh1 -null mice and it was found that the expression of Msx genes persisted. Importantly, Msx1 and Msx3 expressions expanded in response to the elimination of Atoh1 . These results point to early markers of cerebellar progenitor zones and more importantly to an updated view of the molecular parcellation of the RL with respect to the canonical marker of the RL, Atoh1 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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