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Enregistrement W4389336549 · doi:10.1128/spectrum.04981-22

<i>Salmonella</i> actively modulates TFEB in murine macrophages in a growth-phase and time-dependent manner

2023· article· en· W4389336549 sur OpenAlexafffund
Subothan Inpanathan, Erika Ospina-Escobar, Vanessa Cruz Li, Zainab Adamji, Tracy Lackraj, Youn Hee Cho, Natasha Porco, Christopher H. Choy, Joseph B. McPhee, Roberto J. Botelho

Notice bibliographique

RevueMicrobiology Spectrum · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaToronto Metropolitan UniversityOntario Ministry of Economic Development, Job Creation and TradeCanada Foundation for InnovationCanada Research ChairsGovernment of Canada
Mots-clésSalmonellaBiologyPhase (matter)Cell biologyMicrobiologyChemistryGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The transcription factor TFEB drives the expression of lysosomal, autophagic, and immune-responsive genes in response to LPS and phagocytosis. Interestingly, compounds that promote TFEB activity enhance bactericidal activity, while intracellular pathogens like Mycobacterium and Salmonella repress TFEB. However, Salmonella enterica sv. Typhimurium ( S . Typhimurium) was reported to actively stimulate TFEB, implying a benefit to Salmonella . To better understand the relationship between S . Typhimurium and TFEB, we assessed if S . Typhimurium regulated TFEB in macrophages in a manner dependent on infection conditions. We observed that macrophages that engulfed late-logarithmic grown Salmonella accumulated nuclear TFEB, comparable to macrophages that engulfed Escherichia coli . In contrast, stationary-phase S . Typhimurium infection of macrophages actively delayed TFEB nuclear mobilization. The delay in TFEB nuclear mobilization was not observed in macrophages that engulfed heat-killed stationary-phase Salmonella , or Salmonella lacking functional SPI-1 and SPI-2 type 3 secretion systems. S . Typhimurium mutated in the master virulence regulator phoP or the secreted effector genes sifA , and sopD also showed TFEB nuclear translocation. Interestingly, while E. coli survived better in tfeb −/− macrophages, S . Typhimurium growth was similar in wild-type and tfeb −/− macrophages. Moreover, Salmonella survival was not readily affected by its growth phase in wild-type or knockout macrophages, though in HeLa cells late-log Salmonella benefitted from the loss of TFEB. Priming macrophages with phagocytosis enhanced the killing of Salmonella in wild-type, but not in tfeb − /− macrophages. Collectively, S . Typhimurium orchestrate TFEB in a manner dependent on infection conditions, while disturbing this context-dependent control of TFEB may be detrimental to Salmonella survival. IMPORTANCE Activation of the host transcription factor TFEB helps mammalian cells adapt to stresses such as starvation and infection by upregulating lysosome, autophagy, and immuno-protective gene expression. Thus, TFEB is generally thought to protect host cells. However, it may also be that pathogenic bacteria like Salmonella orchestrate TFEB in a spatio-temporal manner to harness its functions to grow intracellularly. Indeed, the relationship between Salmonella and TFEB is controversial since some studies showed that Salmonella actively promotes TFEB, while others have observed that Salmonella degrades TFEB and that compounds that promote TFEB restrict bacterial growth. Our work provides a path to resolve these apparent discordant observations since we showed that stationary-grown Salmonella actively delays TFEB after infection, while late-log Salmonella is permissive of TFEB activation. Nevertheless, the exact function of this manipulation remains unclear, but conditions that erase the conditional control of TFEB by Salmonella may be detrimental to the microbe.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,641

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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