Exploring the dynamics of the 2022 mpox outbreak in Canada
Notice bibliographique
Résumé
The 2022 mpox outbreak predominantly impacted gay, bisexual, and other men who have sex with men (gbMSM). Two models were developed to support situational awareness and management decisions in Canada. A compartmental model characterized epidemic drivers at national/provincial levels, while an agent-based model (ABM) assessed municipal-level impacts of vaccination. The models were parameterized and calibrated using empirical case and vaccination data between 2022 and 2023. The compartmental model explored: (1) the epidemic trajectory through community transmission, (2) the potential for transmission among non-gbMSM, and (3) impacts of vaccination and the proportion of gbMSM contributing to disease transmission. The ABM incorporated sexual-contact data and modeled: (1) effects of vaccine uptake on disease dynamics, and (2) impacts of case importation on outbreak resurgence. The calibrated, compartmental model followed the trajectory of the epidemic, which peaked in July 2022, and died out in December 2022. Most cases occurred among gbMSM, and epidemic trajectories were not consistent with sustained transmission among non-gbMSM. The ABM suggested that unprioritized vaccination strategies could increase the outbreak size by 47%, and that consistent importation (≥5 cases per 10 000) is necessary for outbreak resurgence. These models can inform time-sensitive situational awareness and policy decisions for similar future outbreaks.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».