MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4389391383 · doi:10.1002/pd.6466

Monogenic conditions and central nervous system anomalies: A prospective study, systematic review and meta‐analysis

2023· review· en· W4389391383 sur OpenAlexaff
Gillian Blayney, Eoghan Laffan, Preethi A. Jacob, Caitlin Baptiste, Heinz Gabriel, Teresa N. Sparks, Yuval Yaron, Mary E. Norton, Karin E. M. Diderich, Yiming Wang, Karen Chong, David Chitayat, Neelam Saini, Shagun Aggarwal, Montse Pauta, A. Borrell, Kelly L. Gilmore, Natalie Chandler, Stephanie Allen, Neeta L. Vora, Abdul Noor, Caitriona Monaghan, Mark D. Kilby, Ronald J. Wapner, Lyn S. Chitty, Fionnuala Mone

Notice bibliographique

RevuePrenatal Diagnosis · 2023
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePrenatal Screening and Diagnostics
Établissements canadiensMount Sinai HospitalSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute for Health and Care ResearchGreat Ormond Street Institute of Child HealthNational Institute of Child Health and Human DevelopmentUniversity of North Carolina at Chapel HillNational Institutes of Health
Mots-clésExome sequencingMedicineLissencephalyMeta-analysisExomeBioinformaticsPathologyBiologyGeneticsPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Objectives Determine the incremental diagnostic yield of prenatal exome sequencing (pES) over chromosome microarray (CMA) or G‐banding karyotype in fetuses with central nervous system (CNS) abnormalities. Methods Data were collected via electronic searches from January 2010 to April 2022 in MEDLINE, Cochrane, Web of Science and EMBASE. The NHS England prenatal exome cohort was also included. Incremental yield was calculated as a pooled value using a random‐effects model. Results Thirty studies were included ( n = 1583 cases). The incremental yield with pES for any CNS anomaly was 32% [95%CI 27%–36%; I 2 = 72%]. Subgroup analysis revealed apparent incremental yields in; (a) isolated CNS anomalies; 27% [95%CI 19%–34%; I 2 = 74%]; (b) single CNS anomaly; 16% [95% CI 10%–23%; I 2 = 41%]; (c) more than one CNS anomaly; 31% [95% Cl 21%–40%; I 2 = 56%]; and (d) the anatomical subtype with the most optimal yield was Type 1 malformation of cortical development, related to abnormal cell proliferation or apoptosis, incorporating microcephalies, megalencephalies and dysplasia; 40% (22%–57%; I 2 = 68%). The commonest syndromes in isolated cases were Lissencephaly 3 and X‐linked hydrocephalus. Conclusions Prenatal exome sequencing provides a high incremental diagnostic yield in fetuses with CNS abnormalities with optimal yields in cases with multiple CNS anomalies, particularly those affecting the midline, posterior fossa and cortex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,612
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0100,002
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,070
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePrenatal DiagnosisMême sujetPrenatal Screening and DiagnosticsTravaux en français237 207