MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4389436613 · doi:10.1212/wnl.82.10_supplement.p2.183

<i>CLN6</i> Mutations Cause Teenage-Onset Progressive Myoclonus Epilepsy (P2.183)

2014· article· en· W4389436613 sur OpenAlexaff
Danielle M. Andrade, Tara Paton, Julie Turnbull, Christine Klein, Christian Marshall, Stephen W. Scherer, Berge A. Minassian

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlycogen Storage Diseases and Myoclonus
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenKrembil FoundationUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProgressive myoclonus epilepsyMyoclonusEpilepsyMedicinePsychiatryPediatricsPsychologyPsychoanalysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE/BACKGROUND: Progressive myoclonus epilepsy (PME) afflicts mainly teenagers. PME in young children and adults is mostly caused by neuronal ceroid lipofuscinosis (NCL). Using a whole-exome sequencing (WES) approach, we find that NCL is also a cause of teenage-onset PME. DESIGN/METHODS: A 24 year-old Pashtun Afghani man presented with myoclonus at age 15 years. Seizures and cognitive decline appeared later. Two cousins had the same disease and age of onset. Both died around age 30 with severe dementia. Investigations showed cortical myoclonus, multifocal epileptiform discharges, and generalized brain atrophy. Testing for known causes of teenage-onset PMEs were negative. Homozygosity mapping and WES, were performed to identify the disease gene. RESULTS: 600,000 SNPs were genotyped in the proband and one affected cousin. Homozygosity mapping revealed two shared regions of homozygosity. WES yielded 41,597 genetic variants of which only two were exonic, novel, nonsynonymous, and located within one of the shared homozygous regions. One variant was expressed in testis. The other variant was a homozygous sequence change in the CLN6 gene. This variant segregates with the disease in the pedigree. Sequencing for it in 268 control individuals, including 176 Pashtun, revealed it in one Pashtun, in heterozygote state. CONCLUSIONS: The patients in our study closely resemble Kufs disease generally, and the teenage-onset cases of Arsov et al. in particular. Combining this with our findings that the CLN6 sequence change we identified affects a highly conserved amino acid, is the only homozygous exomic alteration in a brain-expressed gene in a shared region of homozygosity, and is not present in homozygous state in vast control sequence datasets and 176 ethnic matches, confirms that CLN6 c.768C>G (D256E) is the mutation in our family. Combined WES and homozygosity mapping in two patients from one family without a priori hypothesis led directly to the causative defect.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,377
Score d'incertitude au seuil0,859

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeurologyMême sujetGlycogen Storage Diseases and MyoclonusTravaux en français237 207