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Enregistrement W4389436868 · doi:10.1212/wnl.82.10_supplement.s46.001

Exome Sequencing Identifies PINCH2 Mutations in Early Onset Autosomal Recessive LGMD with Severe Cardiomyopathy and Triangular Tongues (S46.001)

2014· article· en· W4389436868 sur OpenAlexaff
Jodi Warman‐Chardon, Amanda Smith, John Woulfe, Kawan Rakhra, Elena Pena Fernandez, Chandree L. Beaulieu, Jeremy Schwartzentruber, Cynthia Hawkins, Matthew B. Harms, Mei Zhang, Jacek Majewski, Dennis E. Bulman, Kym M. Boycott, David A. Dyment

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensMcGill University and Génome Québec Innovation CentreOttawa HospitalAgricultural Research Institute of OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExome sequencingCardiomyopathyMedicineExomeGeneticsMutationPathologyBiologyGeneInternal medicineHeart failure

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Utilize whole exome sequencing for molecular identification in undiagnosed siblings with limb girdle muscular dystrophy (LGMD). BACKGROUND: LGMD is a heterogeneous group of inherited disorders leading to progressive muscle degeneration and often associated with cardiac complications. A large portion of patients with LGMD remain genetically undiagnosed. DESIGN/METHODS: We investigated affected adult siblings with a childhood onset LGMD with macroglossia and calf enlargement using genetic, imaging and pathological testing. RESULTS: The patients demonstrated severe quadriparesis with a broad based triangular tongue and biventricular cardiac dysfunction. Musculoskeletal Magnetic Resonance (MR) demonstrates bilateral, symmetric, severe atrophy and fat infiltration in proximal, distal and trunk musculature. Cardiac MR shows biventricular dilatation and systolic dysfunction along with subepicardial pattern of delayed enhancement in the inferior and inferolateral walls of the left ventricle indicating fibrosis. After negative genetic evaluation for known LGMD genes, we performed whole exome sequencing of the affected siblings and identified shared compound heterozygous missense mutations in exon 5 (c.C356T; p.P119L and c.C342G; p.N114K) and exon 11 (c.T1034C; p.L345P) in PINCH2 (also known as LIMS2), which segregated appropriately in the family. Muscle biopsy showed dystrophic features and the z-line pattern of PINCH2 staining seen in control was disrupted. PINCH2 is an important member of the IPP (ILK, Parvin, PINCH) heterotrimeric complex, essential for signaling through integrin adhesion receptors that regulates cell migration, spreading and adhesion, and is found in skeletal and cardiac muscle cells in mouse and zebrafish models. The IPP complex stabilizes expression of the component proteins by reducing proteasomal degradation. PINCH1 may compensate for loss of PINCH2 in some tissues, suggesting that potential therapy may involve upregulation of PINCH1 to stabilize the IPP complex in patients with PINCH2 mutations. CONCLUSIONS: We identify patients with a severe LGMD with cardiomyopathy and triangular tongues. Although well established in animal models, this is the first report of defective PINCH2 causing LGMD with cardiomyopathy in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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