MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4389454823 · doi:10.3138/jammi-2023-0009

Finding significant pathogens in blood cultures in children: Should we set the timer to 36 hours?

2023· article· en· W4389454823 sur OpenAlexaffvenueabout
Eugene Y. H. Yeung, Nadia Sant, Ewa Sucha, Reza Belaghi, Nicole Le Saux

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Identification and Susceptibility Testing
Établissements canadiensCanadian Electricity AssociationChildren's Hospital of Eastern OntarioOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineDiscontinuationBlood cultureBacteremiaHazard ratioInternal medicineConfidence intervalPediatricsGastroenterologyAntibioticsBiologyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Knowledge of time to positivity (TTP) for blood cultures is useful to assess timing of discontinuation of empiric antimicrobials for suspected bacteremia with no focus. Methods: An audit of positive blood cultures from the Children's Hospital of Eastern Ontario (CHEO) from November 1, 2019, to October 31, 2020, was performed to determine TTP, defined as the start of incubation to a positive signal from automated incubators. Results: Three hundred seventy-six positive blood cultures were identified from 248 patients (average age: 6.27 [SD 6.24] years). Of these, 247 isolates were speciated; 90 (36.4%) were definitive/probable (DP) pathogens (median TTP 12.75 hours) and 157 (63.6%) possible/probable (PP) contaminants (median TTP 24.08 hours). At each time point, the adjusted rate of positive blood culture was significantly higher for DP pathogens compared to PP contaminants (hazard ratio [HR] 1.80 [95% CI 1.37, 2.36]) and for children ≤27 days old compared to the oldest age group (HR 1.94 [95% CI 1.19, 3.17]). By 36 hours, the proportion of positive cultures was significantly higher in the youngest age group (≤27 days) compared with the 3-11 years old age group (91.7% [95% CI 68.6%, 97.8%] versus 58.2% [95% CI 46.91%, 68.06%]). Conclusion: Across all ages, the TTP was significantly shorter for blood cultures with DP pathogens compared to those with PP contaminants (HR 1.80 [95% CI 1.37, 2.36]). In newborns, 90% of blood cultures were positive by 36 hours supporting this re-assessment time for empiric antimicrobials. TTP was longer in children ≥12 months, possibly related to other factors such as blood culture volume.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil0,950

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2023
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease CanadaMême sujetBacterial Identification and Susceptibility TestingTravaux en français237 207