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Enregistrement W4389476433 · doi:10.1101/2023.12.07.570646

Self-renewing Sox9+ osteochondral stem cells in the postnatal skeleton

2023· preprint· en· W4389476433 sur OpenAlexafffund
Stephanie Farhat, Bahaeddine Tilouche, Spencer Short, Medjie Piron, T. Mark Campbell, José Alex Lourenço Fernandes, Mariya Somyk, Hina Bandukwala, Eric Arezza, Quentin Sastourné-Arrey, Katherine Reilly, Maria Abou Chakra, Gary D. Bader, Leo Kunz, Timm Schroeder, Sasha Carsen, Pierre Mattar, F. Jeffrey Dilworth, Daniel L. Coutu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMesenchymal stem cell research
Établissements canadiensUniversity of TorontoÉlisabeth Bruyère HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesStem Cell Network
Mots-clésStem cellBiologyCell biologyRegeneration (biology)Skeletal muscleAdult stem cellTranscriptomeSOX9Stem cell theory of agingProgenitor cellAnatomyIn vitroEndothelial stem cellGeneticsStem cell factorTranscription factorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Postnatal skeletal growth, homeostatic maintenance, and regeneration is driven by skeletal stem cells. In addition, it is well established that skeletal tissues lose their regenerative potential with age, comorbidities, and repeated trauma, possibly through stem cell exhaustion or loss of function. However, it is largely unknown where these cells reside in skeletal tissues, what molecular mechanisms regulate their self-renewal and fate decisions, and how to isolate, purify, and expand them ex vivo. Therefore, there is an urgent need for a deeper understanding of postnatal skeletal stem cells. Here, we used genetic lineage tracing, thymidine analogues retention, whole bone microscopy, imaging cytometry, in vitro assays, and single cell transcriptomics and provide the first experimental evidence for the existence of self-renewing osteochondral stem cells in the postnatal skeleton in both males and females. We also show direct comparisons between adult, fetal, mouse, and human skeletal stem cells at the transcriptome level.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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