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Enregistrement W4389476622 · doi:10.1038/s41598-023-48721-1

Reproducible and clinically translatable deep neural networks for cervical screening

2023· article· en· W4389476622 sur OpenAlexaff
Syed Rakin Ahmed, Brian Befano, Andréanne Lemay, Didem Egemen, Ana Cecilia Rodríguez, Sandeep Angara, Kanan Desai, José Jerónimo, Sameer Antani, Nicole G. Campos, Federica Inturrisi, Rebecca B. Perkins, Aimée R. Kreimer, Nicolas Wentzensen, Rolando Herrero, Marta del Pino, Wim Quint, Sílvia de Sanjosé, Mark Schiffman, Jayashree Kalpathy–Cramer

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCervical Cancer and HPV Research
Établissements canadiensPolytechnique Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTriageCervical cancerArtificial intelligenceReceiver operating characteristicMachine learningMedicineComputer scienceVisual inspectionCervixDeep learningPopulationCancerEmergency medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cervical cancer is a leading cause of cancer mortality, with approximately 90% of the 250,000 deaths per year occurring in low- and middle-income countries (LMIC). Secondary prevention with cervical screening involves detecting and treating precursor lesions; however, scaling screening efforts in LMIC has been hampered by infrastructure and cost constraints. Recent work has supported the development of an artificial intelligence (AI) pipeline on digital images of the cervix to achieve an accurate and reliable diagnosis of treatable precancerous lesions. In particular, WHO guidelines emphasize visual triage of women testing positive for human papillomavirus (HPV) as the primary screen, and AI could assist in this triage task. In this work, we implemented a comprehensive deep-learning model selection and optimization study on a large, collated, multi-geography, multi-institution, and multi-device dataset of 9462 women (17,013 images). We evaluated relative portability, repeatability, and classification performance. The top performing model, when combined with HPV type, achieved an area under the Receiver Operating Characteristics (ROC) curve (AUC) of 0.89 within our study population of interest, and a limited total extreme misclassification rate of 3.4%, on held-aside test sets. Our model also produced reliable and consistent predictions, achieving a strong quadratic weighted kappa (QWK) of 0.86 and a minimal %2-class disagreement (% 2-Cl. D.) of 0.69%, between image pairs across women. Our work is among the first efforts at designing a robust, repeatable, accurate and clinically translatable deep-learning model for cervical screening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,383
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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