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Enregistrement W4389504945 · doi:10.1136/bmjopen-2023-077772

Protocol for the Tallaght University Hospital Institute for Memory and Cognition-Biobank for Research in Ageing and Neurodegeneration

2023· article· en· W4389504945 sur OpenAlexfundno aff
Adam H. Dyer, Helena Dolphin, Antoinette O’Connor, Laura Morrison, Gavin Sedgwick, Aoife McFeely, Emily Killeen, Conal Gallagher, Naomi Davey, Eimear Connolly, Shane Lyons, Conor Young, Christine Gaffney, Ruth Ennis, Cathy McHale, Jasmine Joseph, Graham Knight, Emmet Kelly, Cliona O’Farrelly, Nollaig M. Bourke, Aoife Fallon, Seán O’Dowd, Seán Kennelly

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesHealth Research BoardHealth Service ExecutiveWellcome TrustMeath FoundationCanadian Institute for Theoretical Astrophysics
Mots-clésBiobankMedicineDementiaBiorepositoryNeuropsychologyDiseaseCognitive declineCognitionClinical Dementia RatingPsychiatryBioinformaticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Alzheimer's disease and other dementias affect >50 million individuals globally and are characterised by broad clinical and biological heterogeneity. Cohort and biobank studies have played a critical role in advancing the understanding of disease pathophysiology and in identifying novel diagnostic and treatment approaches. However, further discovery and validation cohorts are required to clarify the real-world utility of new biomarkers, facilitate research into the development of novel therapies and advance our understanding of the clinical heterogeneity and pathobiology of neurodegenerative diseases. METHODS AND ANALYSIS: The Tallaght University Hospital Institute for Memory and Cognition Biobank for Research in Ageing and Neurodegeneration (TIMC-BRAiN) will recruit 1000 individuals over 5 years. Participants, who are undergoing diagnostic workup in the TIMC Memory Assessment and Support Service (TIMC-MASS), will opt to donate clinical data and biological samples to a biobank. All participants will complete a detailed clinical, neuropsychological and dementia severity assessment (including Addenbrooke's Cognitive Assessment, Repeatable Battery for Assessment of Neuropsychological Status, Clinical Dementia Rating Scale). Participants undergoing venepuncture/lumbar puncture as part of the clinical workup will be offered the opportunity to donate additional blood (serum/plasma/whole blood) and cerebrospinal fluid samples for longitudinal storage in the TIMC-BRAiN biobank. Participants are followed at 18-month intervals for repeat clinical and cognitive assessments. Anonymised clinical data and biological samples will be stored securely in a central repository and used to facilitate future studies concerned with advancing the diagnosis and treatment of neurodegenerative diseases. ETHICS AND DISSEMINATION: Ethical approval has been granted by the St. James's Hospital/Tallaght University Hospital Joint Research Ethics Committee (Project ID: 2159), which operates in compliance with the European Communities (Clinical Trials on Medicinal Products for Human Use) Regulations 2004 and ICH Good Clinical Practice Guidelines. Findings using TIMC-BRAiN will be published in a timely and open-access fashion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,050
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,089
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,232
Score d'incertitude au seuil0,778

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0500,089
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,002
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0050,002
Communication savante0,0050,003
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0050,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2320,089

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,268
Tête enseignante GPT0,512
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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