A Novel Heterozygous Mutation c.1627G>T (p.Gly543Cys) in the SLC34A1 Gene in a Male Patient with Recurrent Nephrolithiasis and Early Onset Osteopenia: A Case Report
Notice bibliographique
Résumé
Serum phosphate concentration is regulated by renal phosphate reabsorption and mediated by sodium–phosphate cotransporters. Germline mutations in genes encoding these cotransporters have been associated with clinical phenotypes, variably characterized by hyperphosphaturia, hypophosphatemia, recurrent kidney stones, skeletal demineralization, and early onset osteoporosis. We reported a 33-year-old male patient presenting a history of recurrent nephrolithiasis and early onset osteopenia in the lumbar spine and femur. He was tested, through next generation sequencing (NGS), by using a customized multigenic panel containing 33 genes, whose mutations are known to be responsible for the development of congenital parathyroid diseases. Two further genes, SLC34A1 and SLC34A3, encoding two sodium–phosphate cotransporters, were additionally tested. A novel germline heterozygous mutation was identified in the SLC34A1 gene, c.1627G>T (p.Gly543Cys), currently not reported in databases of human gene mutations and scientific literature. SLC34A1 germline heterozygous mutations have been associated with the autosomal dominant hypophosphatemic nephrolithiasis/osteoporosis type 1 (NPHLOP1). Consistently, alongside the clinical features of NPHLOP1, our patient experienced recurrent nephrolithiasis and lumbar and femoral osteopenia at a young age. Genetic screening for the p.Gly453Cys variant and the clinical characterization of his first-degree relatives associated the presence of the variant in one younger brother, presenting renal colic and microlithiasis, suggesting p.Gly453Cys is possibly associated with renal altered function in the NPHLOP1 phenotype.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».