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Enregistrement W4389613600 · doi:10.1101/2023.12.10.23299793

Utility of Cerebrospinal Fluid Protein Levels as a Potential Predictive Biomarker of Disease Severity in HIV-Associated Cryptococcal Meningitis

2023· preprint· en· W4389613600 sur OpenAlexfundno aff
John Kasibante, Eesha Irfanullah, Abduljewad Wele, Elizabeth C Okafor, Kenneth Ssebambulidde, Samuel Okurut, Enock Kagimu, Jane Gakuru, Morris K Rutakingirwa, Timothy Mugabi, Edwin Nuwagira, Samuel Jjunju, Edward Mpoza, Lillian Tugume, Laura Nsangi, Abdu K Musibire, Conrad Muzoora, Joshua Rhein, David B. Meya, David R. Boulware, Mahsa Abassi

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFogarty International CenterNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMedical Research CouncilGrand Challenges CanadaDepartment of Health and Social CareEuropean and Developing Countries Clinical Trials PartnershipWellcome TrustStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésCryptococcal meningitisBiomarkerCerebrospinal fluidMedicineDiseaseImmunologyMeningitisHuman immunodeficiency virus (HIV)Internal medicineBiologyPediatricsViral disease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Cerebrospinal fluid (CSF) protein levels exhibit high variability in HIV-associated cryptococcal meningitis from being normal to markedly elevated. However, the clinical implications of CSF protein levels in cryptococcal meningitis remain unclear. Methods: We analysed data from 890 adults with HIV-associated cryptococcal meningitis randomized into two clinical trials in Uganda between 2015 and 2021. CSF protein was grouped into ≥100 mg/dL (n=249) and <100 mg/dL (n=641). We described baseline clinical variables and mortality by CSF protein levels. Results: Approximately one-third of individuals had a baseline CSF protein ≥100 mg/dL. Those with CSF protein ≥100 mg/dL were more likely to present with Glasgow coma scale scores <15 (P<0.01), self-reported seizures at baseline (P=0.02), higher CD4 T-cells (p<0.001), and higher CSF white cells (p<0.001). Moreover, those with a baseline CSF protein ≥100 mg/dL also had a lower baseline CSF fungal burden (p<0.001) and a higher percentage of sterile CSF cultures at day 14 (p=0.02). Individuals with CSF protein ≥100 mg/dL demonstrated a more pronounced immune response consisting of upregulation of immune effector molecules pro-inflammatory cytokines, type-1 T-helper cell cytokines, type-3 chemokines, and immune-exhaustion marker (p<0.05). 18-week mortality risk in individuals with a CSF protein <100 mg/dL was 34% higher, (unadjusted Hazard Ratio 1.34; 95% CI, 1.05 to 1.70; p=0.02) than those with ≥100 mg/dL. Conclusion: In cryptococcal meningitis, individuals with CSF protein ≥100 mg/dL more frequently presented with seizures, altered mental status, immune activation, and favourable fungal outcomes. Baseline CSF protein levels may serve as a surrogate marker of immune activation and prognosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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