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Enregistrement W4389721957 · doi:10.1162/imag_a_00058

Spatial-extent inference for testing variance components in reliability and heritability studies

2023· article· en· W4389721957 sur OpenAlexafffund
Ruyi Pan, Erin W. Dickie, Colin Hawco, Nancy Reid, Aristotle N. Voineskos, Jun Young Park

Notice bibliographique

RevueImaging Neuroscience · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods and Bayesian Inference
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthCanadian Institutes of Health ResearchMcDonnell Center for Systems NeuroscienceNational Institutes of HealthConnaught FundNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCentre for Addiction and Mental Health FoundationUniversity of TorontoNational Alliance for Research on Schizophrenia and Depression
Mots-clésHeritabilityVariance componentsInferenceReliability (semiconductor)Variance (accounting)StatisticsReliability engineeringComputer scienceMathematicsArtificial intelligenceEngineeringEvolutionary biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Clusterwise inference is a popular approach in neuroimaging to increase sensitivity, but most existing methods are currently restricted to the General Linear Model (GLM) for testing mean parameters. Statistical methods for testing variance components, which are critical in neuroimaging studies that involve estimation of narrow-sense heritability or test-retest reliability, are underdeveloped due to methodological and computational challenges, which would potentially lead to low power. We propose a fast and powerful test for variance components called CLEAN-V (CLEAN for testing Variance components). CLEAN-V models the global spatial dependence structure of imaging data and computes a locally powerful variance component test statistic by data-adaptively pooling neighborhood information. Correction for multiple comparisons is achieved by permutations to control family-wise error rate (FWER). Through analysis of task-functional magnetic resonance imaging (fMRI) data from the Human Connectome Project across five tasks and comprehensive data-driven simulations, we show that CLEAN-V outperforms existing methods in detecting test-retest reliability and narrow-sense heritability with significantly improved power, with the detected areas aligning with activation maps. The computational efficiency of CLEAN-V also speaks of its practical utility, and it is available as an R package.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,044
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,187
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,044
Score d'incertitude au seuil0,235

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0440,187
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,247
Tête enseignante GPT0,441
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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