A multitrait genetic study of hemostatic factors and hemorrhagic transformation after stroke treatment
Notice bibliographique
Résumé
Background Thrombolytic recombinant tissue-plasminogen activator (r-tPA) treatment is the only pharmacological intervention available in the ischemic stroke acute phase. This treatment is associated with an increased risk of intracerebral hemorrhages, known as hemorrhagic transformations (HT), which worsen patient’s prognosis. Objectives To investigate the association between genetically-determined natural hemostatic factors’ levels, with increased risk of HT after r-tPA treatment. Patients/Methods Using genome-wide association studies data on risk of HT after r-tPA treatment, and from seven hemostatic factors (VII, VIII, von-Willebrand factor [VWF], XI, fibrinogen, plasminogen activator inhibitor-1 [PAI-1], and tissue plasminogen activator [tPA]), we performed local and global genetic correlations estimation multi-trait analyses and colocalization, and two-sample Mendelian Randomization (MR) analyses between hemostatic factors and HT. Results Local correlations identified a genomic region on chromosome 16 with shared covariance: fibrinogen-HT, p-value=2.45×10-11. Multi-trait analysis between fibrinogen-HT revealed 3 loci that simultaneously regulate circulating levels of fibrinogen and risk of HT: rs56026866 (PLXND1), p-value=8.80×10-10, rs1421067 (CHD9), p-value=1.81×10-14, and rs34780449, near ROBO1 gene, p-value=1.64×10-08. Multi-trait analysis between VWF-HT showed a novel common association regulating VWF and risk of HT after r-tPA at rs10942300 (ZNF366), p-value=1.81×10-14. MR analysis did not find significant causal associations, although a nominal association was observed for FXI-HT (inverse variance weighted estimate [SE], 0.07[-0.29–0.00]; OR 0.87[0.75–1.00], raw-p-value=0.05). Conclusions We identified 4 shared loci between hemostatic factors and HT after r-tPA treatment, suggesting common regulatory mechanisms between fibrinogen and VWF levels and HT. Further research to determine a possible mediating effect of fibrinogen on HT risk are needed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».