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Enregistrement W4389765971 · doi:10.1177/09622802231215804

Privacy-preserving analysis of time-to-event data under nested case-control sampling

2023· article· en· W4389765971 sur OpenAlexafffund
Lamin Juwara, Yi Yang, Ana Míriam Velly, Paramita Saha‐Chaudhuri

Notice bibliographique

RevueStatistical Methods in Medical Research · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiquePrivacy-Preserving Technologies in Data
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacs
Mots-clésNested case-control studyPoolingComputer scienceEstimatorEvent (particle physics)Data miningCovariateSampling (signal processing)StatisticsProportional hazards modelRegression analysisEconometricsCohortMachine learningArtificial intelligenceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Analyses of distributed data networks of rare diseases are constrained by legitimate privacy and ethical concerns. Analytical centers (e.g. research institutions) are thus confronted with the challenging task of obtaining data from recruiting sites that are often unable or unwilling to share personal records of participants. For time-to-event data, recently popularized disclosure techniques with privacy guarantees (e.g., Differentially Private Generative Adversarial Networks) are generally computationally expensive or inaccessible to applied researchers. To perform the widely used Cox proportional hazards regression, we propose an easy-to-implement privacy-preserving data analysis technique by pooling (i.e. aggregating) individual records of covariates at recruiting sites under the nested case-control sampling framework before sharing the pooled nested case-control subcohort. We show that the pooled hazard ratio estimators, under the pooled nested case-control subsamples from the contributing sites, are maximum likelihood estimators and provide consistent estimates of the individual level full cohort HRs. Furthermore, a sampling technique for generating pseudo-event times for individual subjects that constitute the pooled nested case-control subsamples is proposed. Our method is demonstrated using extensive simulations and analysis of the National Lung Screening Trial data. The utility of our proposed approach is compared to the gold standard (full cohort) and synthetic data generated using classification and regression trees. The proposed pooling technique performs to near-optimal levels comparable to full cohort analysis or synthetic data; the efficiency improves in rare event settings when more controls are matched on during nested case-control subcohort sampling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,036
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,100
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,192

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0360,100
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,294
Tête enseignante GPT0,564
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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