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Enregistrement W4389802487 · doi:10.36185/2532-1900-339

The atrial and ventricular myocardial proteome of end-stage lamin heart disease.

2023· article· en· W4389802487 sur OpenAlexaff
Constantin‐Cristian Topriceanu, Mashael Alfarih, Alun D. Hughes, Hunain Shiwani, Fiona Chan, Saidi Mohiddin, William E. Moody, Richard P. Steeds, Benjamin O’Brien, Jakob Vowinckel, Petros Syrris, Caroline Coats, Stephen Pettit, Eloisa Arbustini, James Moon, Gabriella Captur

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNuclear Structure and Function
Établissements canadiensUniversity Hospital Foundation
Organismes subventionnairesBritish Heart FoundationNational Institute for Health and Care ResearchBarts Charity
Mots-clésLMNALaminDilated cardiomyopathyVentricleInternal medicineCardiomyopathyCardiologyMedicineEjection fractionHeart failureBiologyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

gene) can lead to dilated cardiomyopathy (DCM). This pilot study sought to explore the postgenomic phenotype of end-stage lamin heart disease. Consecutive patients with end-stage lamin heart disease (LMNA-group, n = 7) and ischaemic DCM (ICM-group, n = 7) undergoing heart transplantation were prospectively enrolled. Samples were obtained from left atrium (LA), left ventricle (LV), right atrium (RA), right ventricle (RV) and interventricular septum (IVS), avoiding the infarcted myocardial segments in the ICM-group. Samples were analysed using a discovery 'shotgun' proteomics approach. We found that 990 proteins were differentially abundant between LMNA and ICM samples with the LA being most perturbed (16-fold more than the LV). Abundance of lamin A/C protein was reduced, but lamin B increased in LMNA LA/RA tissue compared to ICM, but not in LV/RV. Carbonic anhydrase 3 (CA3) was over-abundant across all LMNA tissue samples (LA, LV, RA, RV, and IVS) when compared to ICM. Transthyretin was more abundant in the LV/RV of LMNA compared to ICM, while sarcomeric proteins such as titin and cardiac alpha-cardiac myosin heavy chain were generally less abundant in RA/LA of LMNA. Protein expression profiling and enrichment analysis pointed towards sarcopenia, extracellular matrix remodeling, deficient myocardial energetics, redox imbalances, and abnormal calcium handling in LMNA samples. Compared to ICM, end-stage lamin heart disease is a biventricular but especially a biatrial disease appearing to have an abundance of lamin B, CA3 and transthyretin, potentially hinting to compensatory responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,477
Score d'incertitude au seuil0,154

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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