Abstract 18478: Association of Family History and Cardiomyopathy-Associated Gene Variants of Unknown Significance in Ethnic Minority Patients With Early Onset Atrial Fibrillation
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Underrepresentation of ethnic minorities in genetic studies can complicate interpretation of variants of unknown significance (VUS) in these groups. Likely pathogenic or pathogenic (LP/P) cardiomyopathy (CM) gene variants are associated with early onset-atrial fibrillation (EOAF) in a cohort of predominantly European ancestry, but prevalence in minorities, and the role of VUS, is unclear. Three-generation family history (FH) may provide insight into the potential pathogenicity of VUS in ethnic minorities. Hypothesis: In patients with EOAF and low comorbidity burden carrying CM VUS, does positive FH suggest variant pathogenicity? Aims: To determine whether CM gene VUS in ethnic minority probands with EOAF are associated with a FH of arrhythmia, stroke, or heart failure. Methods: Of 301 individuals from the University of Illinois Health Multi-Ethnic AF Registry who underwent whole exome sequencing, we identified 89 with either LP/P variant, positive FH from medical records, or AF diagnosis age ≤55 years and ≤2 comorbidities. We examined 22 genes strongly associated with CM and graded pathogenicity according to American College of Medical Genetics criteria. A three-generation FH was obtained by contacting probands or family members. Results: A FH was obtained in 36 patients (Figure 1a; median age 52 years, 56% female, 83% African-American, 17% Hispanic/Latinx). LP/P variants were present in 3 (8%) probands, VUS in 10 (28%), and likely benign/benign (LB/B) or no variant in 23 (64%). A FH of arrhythmia, heart failure, or stroke was present in 27 subjects (75%) with a FH of heart failure more likely in VUS carriers compared to those with LB/B or no variant (70% vs 26%, p=0.02), with no difference in FH of arrhythmia or stroke. Conclusion: Probands with EOAF who carry CM VUS have greater rates of FH of heart failure than those without disease-associated variants. This suggests pathogenicity of CM VUS in ethnic minorities with EOAF.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».