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Enregistrement W4389958884 · doi:10.1161/circ.148.suppl_1.15534

Abstract 15534: Identification of Narciclasine, a Potential Drug to Treat PAH by Unbiased Pharmaco-Transcriptomic Study

2023· article· en· W4389958884 sur OpenAlexaff
ANTONELLA ABI SLEIMAN, EL-Kabbout Reem, Mabrouka Salem, Sandra Breuils Bonnet, Sandra Martineau, Alice Bourgeois, Charlie Théberge, Charlotte Romanet, Sarah‐Eve Lemay, Yann Grobs, Olivier Boucherat, Sébastien Bonnet, Steeve Provencher, François Potus

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineTranscriptomePharmacologyIn vivoTreprostinilInflammationCancer researchPathologyPulmonary hypertensionInternal medicineGene expressionBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Pulmonary arterial hypertension (PAH) is a life-threatening vascular disorder characterized by persistent vasoconstriction and detrimental remodeling of the pulmonary blood vessels. This incurable disease is marked by a complex gene expression reprogramming that triggers, among other, metabolic disorders, heightened by inflammation, and the development of a pro-survival phenotype in pulmonary arterial smooth muscle cells (PASMC).We conducted an unbiased transcriptomic study using lung samples from 16 PAH patients and 12 non-PAH controls and identified 4013 differentially expressed genes. Leveraging in silico pharmaco-transcriptomic analysis (utilizing the Lincs and Sigcom databases), we identified narciclasine as a potential drug. Hypothesis: Consequently, we hypothesized that narciclasine could offer improvements in PAH. Methods and Results: In vivo , we administered narciclasine treatment (1 mg/kg, 2 weeks, gavage) in a murine model of PH (monocrotaline model, 60 mg/kg, sc.) and observed improved PH hemodynamics (RVSP, PAAT, TPR), reduced inflammation (CD68 immunofluorescence (IF)), decreased PASMC survival (PCNA and cleaved caspase 3 IF), and alleviated adverse vascular remodeling (Elastic van Gieson Stain Kit). In vitro , narciclasine exhibited a dose-dependent reduction of cell proliferation (IF: ki67; Western blot Survivin, PCNA and PLK1) and increased apoptosis PAH-PASMC (IF: cleaved caspase 3; Wb: Bax and Bcl2). Transcriptomic study (conducted in treated PASMCs) reveals that the therapeutic effects of narciclasine in PAH may be attributed to decreased glycosylation (Gene Ontology analysis). We further observed increased glycosylation in remodeled arteries from PAH lungs, PH preclinical models, and cultured PASMC (Periodic Acid Schiff Kit). Subsequently, we validated that narciclasine reduced glycosylation and downregulated the expression of glycosylation enzymes (by wb: GFAT, NGT, OGT) both in vitro and in vivo. Statistical tests used: unpaired t (2 groups), ANOVA (> 2 groups). Conclusions: In conclusion, our unbiased pharmaco-transcriptomic study identifies narciclasine as a potential therapeutic drug for PAH. Notably, its efficacy appears to be mediated by the reduction of glycosylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,325
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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