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Enregistrement W4389978781 · doi:10.1021/jacs.3c09495

Selective Glycan Labeling of Mannose-Containing Glycolipids in Mycobacteria

2023· article· en· W4389978781 sur OpenAlexfundno aff
So Young Lee, Victoria M. Marando, Stephanie R. Smelyansky, Daria E. Kim, Phillip J. Calabretta, Theodore C. Warner, Bryan D. Bryson, Laura L. Kiessling

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCommon FundDivision of Graduate EducationNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésChemistryGlycolipidGlycanMannoseBiochemistryMicrobiologyGlycoprotein

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycobacterium tuberculosis ( Mtb ) is one of history’s most successful human pathogens. By subverting typical immune responses, Mtb can persist within a host until conditions become favorable for growth and proliferation. Virulence factors that enable mycobacteria to modulate host immune systems include a suite of mannose-containing glycolipids: phosphatidylinositol mannosides, lipomannan, and lipoarabinomannan (LAM). Despite their importance, tools for their covalent capture, modification, and imaging are limited. Here, we describe a chemical biology strategy to detect and visualize these glycans. Our approach, biosynthetic incorporation, is to synthesize a lipid-glycan precursor that can be incorporated at a late-stage step in glycolipid biosynthesis. We previously demonstrated selective mycobacterial arabinan modification by biosynthetic incorporation using an exogenous donor. This report reveals that biosynthetic labeling is general and selective: it allows for cell surface mannose-containing glycolipid modification without nonspecific labeling of mannosylated glycoproteins. Specifically, we employed azido-( Z,Z )-farnesyl phosphoryl-β- d -mannose probes and took advantage of the strain-promoted azide–alkyne cycloaddition to label and directly visualize the localization and dynamics of mycobacterial mannose-containing glycolipids. Our studies highlight the generality and utility of biosynthetic incorporation as the probe structure directs the selective labeling of distinct glycans. The disclosed agents allowed for direct tracking of the target immunomodulatory glycolipid dynamics in cellulo. We anticipate that these probes will facilitate investigating the diverse biological roles of these glycans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,512

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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