MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4389979826 · doi:10.3389/fams.2023.1294540

Mathematical model of physicochemical regulation of precipitation of bone hydroxyapatite

2023· article· en· W4389979826 sur OpenAlexafffund
Hossein Poorhemati, Svetlana V. Komarova

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Applied Mathematics and Statistics · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone health and osteoporosis research
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill UniversityShriners Hospitals for Children - Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSupersaturationMineralization (soil science)ChemistryCalciumPhosphatePrecipitationAqueous solutionBiomineralizationIonic strengthMineralogyChemical engineeringInorganic chemistryBiochemistryNitrogen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Formation of hydroxyapatite in bone, dentin, and enamel occurs at restricted molecular sites of specific extracellular matrix proteins and is controlled by multiple mineralization inhibitors. However, the role of physicochemical factors, such as the availability of required ions and the saturation status of the aqueous environment in biological mineralization, is not fully understood. The goal of this study was to use mathematical modeling to describe the complex physicochemical environment permissive to the precipitation of biological hydroxyapatite. Methods We simulated the processes occurring in the bone interstitial fluid (ISF) defined as an aqueous environment containing seven chemical components (calcium, phosphate, carbonate, sodium, potassium, magnesium, and chloride) that form 30 chemical species. We simulated reversible equilibrium reactions among these chemical species, and calculated supersaturation for hydroxyapatite and its precipitation rate using kinetic theory. Results and Discussion The simulated ISF was of correct ionic strength and predicted the equilibrium component concentrations that were consistent with the experimental findings. Supersaturation of physiological ISF was ~15, which is consistent with prior findings that mineralization inhibitors are required to prevent spontaneous mineral precipitation. Only total calcium, total phosphate and to a lesser degree total carbonate affected ion availability, solution supersaturation and hydroxyapatite precipitation rate. Both calcium and phosphate levels directly affected hydroxyapatite precipitation, and phosphate was affected by pH, which additionally influenced hydroxyapatite precipitation. Integrating mathematical models capturing the physiochemical and biological factors regulating bone mineralization will allow in silico studies of complex clinical scenarios associated with alterations in ISF ion composition, such as rickets, hypophosphatemia, and chronic kidney disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in Applied Mathematics and StatisticsMême sujetBone health and osteoporosis researchTravaux en français237 207