MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4389985558 · doi:10.1101/2023.12.19.572416

Emergence of a senescent and inflammatory pulmonary CD4 <sup>+</sup> T cell population prior to lung allograft failure

2023· preprint· en· W4389985558 sur OpenAlexafffund
Sajad Moshkelgosha, Liran Levy, Shahideh Safavi, S. Karunagaran, Gavin W. Wilson, Benjamin Renaud‐Picard, Goodness Madu, Rashi Ramchandani, Jillian Oliver, Tatsuaki Watanabe, Ke Fan Bei, Betty Joe, Qixuan Li, Ella Huszti, May Cheung, David W. Hedley, Jonathan Yeung, Shaf Keshavjee, Tereza Martinu, S. Juvet

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2023
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of TorontoInstitute of AgingUniversity Health Network
Organismes subventionnairesUniversity Health Network FoundationCanadian Society of Transplantation
Mots-clésLung transplantationLungImmunologyBronchoalveolar lavagePopulationMedicinePulmonary fibrosisTransplantationIdiopathic pulmonary fibrosisFibrosisBiologyPathologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Lung transplantation is a life-saving therapy for end-stage pulmonary disease, but its long-term outlook is poor due to a high incidence of chronic lung allograft dysfunction (CLAD). CLAD results from alloimmune-mediated progressive fibrosis and culminates in death or the need for re-transplantation after a median of 6 years. Existing immunosuppression fails to prevent CLAD, suggesting the existence of alloimmune pathways resistant to these drugs. Here, we used mass cytometry to identify cell populations enriched in the bronchoalveolar lavage (BAL) of patients with subsequent allograft dysfunction. We show that CD4 + CD57 + PD1 + T cells emerge in stable lung transplant recipients in the first year post-transplant, conferring heightened risks for CLAD and death or re-transplantation. CD4 + CD57 + PD1 + T cells display features of senescence and secrete inflammatory cytokines. Cellular indexing by transcriptomes and epitopes (CITE-Seq) on BAL CD4 + T cells revealed the existence of 2 oligoclonal CD57 + subsets with putative cytotoxic and follicular helper functions. Finally, we observed that CD4 + CD57 + PD1 + T cells are associated with lung allograft fibrosis in a mouse model and in human explanted CLAD lungs, where they localize near airway epithelium and B cells. Together, our findings reveal the existence of an inflammatory T cell population that predicts future lung allograft dysfunction and may represent a rational therapeutic target in lung transplant recipients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2023
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetImmune Cell Function and Interaction→Travaux en français237 207→