Biomass losses of Sodalinema alkaliphilum in alkaline, high pH, open raceway ponds
Notice bibliographique
Résumé
Growing cyanobacteria in high pH (10+), high carbonate alkalinity medium (0.5 M) increases the driving force for CO 2 capture and helps exclude competitors and predators. But in these conditions, cyanobacteria might expend more energy to maintain osmotic gradients across their membrane. Thus, these extremophiles may respire more fixed carbon, increasing biomass losses compared to growth in milder conditions. In this work, a microbial consortium primarily composed of Sodalinema alkaliphilum (formerly Phormidium alkaliphilum ) from alkaline soda lakes was grown in an outdoor open raceway pond. Night-time biomass losses were ca. 5 % by mass. Stable isotope probing (SIP) found respiration accounted for 0–2 % of daily biomass losses with no detectable difference in respiration rates between day and night. Comparisons of SIP and mass density measurements indicated respiration was not always the primary driver of biomass loss and that DOC release may contribute, even during stable operation. Proteomics and 16S rRNA DNA sequencing showed the abundance of bacterial heterotrophs was low with Cyclonatronum spp. representing the largest fraction (<1 %). The relative abundance of proteins within the S. alkaliphilum proteome was stable but the rate of protein synthesis varied. Overall rates of protein synthesis were highest in the afternoon (when photosynthesis was most active), but quality control proteins were preferentially made in the morning, likely in preparation for the work ahead. Understanding when and how biomass is lost in cultivation systems is crucial in informing efforts to improve biomass models and enhance biomass yield. • Night-time density measurements revealed biomass losses of ca. 5 %. • Stable isotope probing did not detect diel changes in the biomass respiration rate. • Photosynthesis and protein synthesis were most active in the afternoon. • Proteomics showed diel stability in proteome of Phormidium alkaliphilum . • Quality control proteins were synthesised fastest in the morning.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».