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Enregistrement W4390029679 · doi:10.1016/j.ejphar.2023.176273

Novel hippocampal genes involved in enhanced susceptibility to chronic pain-induced behavioral emotionality

2023· article· en· W4390029679 sur OpenAlexaff
Adam Garman, Allison M. Ash, Ellesavette K. Kokkinos, Dakota Nerland, Lori Winter, Cory Langreck, Morgan L. Forgette, Matthew J. Girgenti, Mounira Banasr, Vanja Đurić

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Pharmacology · 2023
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroinflammation and Neurodegeneration Mechanisms
Établissements canadiensMental Health Research CanadaUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesDalian Maritime UniversityPharmaceutical Research and Manufacturers of America Foundation
Mots-clésHippocampal formationChronic painNeuroinflammationHippocampusNeuroscienceChronic stressEmotionalityMood disordersPsychologyMedicinePsychiatryInflammationInternal medicineAnxiety

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Altered mood and psychiatric disorders are commonly associated with chronic pain conditions; however, brain mechanisms linking pain and comorbid clinical depression are still largely unknown. In this study, we aimed to identify whether key genes/cellular mechanisms underlie susceptibility/resiliency to development of depressive-like behaviors during chronic pain state. Genome-wide RNA-seq analysis was used to examine the transcriptomic profile of the hippocampus, a limbic brain region that regulates mood and stress responses, from male rats exposed to chronic inflammatory pain. Pain-exposed animals were separated into either 'resilient' or 'susceptible' to development of enhanced behavioral emotionality based on behavioral testing. RNA-seq bioinformatic analysis, followed by validation using qPCR, revealed dysregulation of hippocampal genes involved in neuroinflammation, cell cycle/neurogenesis and blood-brain barrier integrity. Specifically, ADAM Metallopeptidase Domain 8 (Adam8) and Aurora Kinase B (Aurkb), genes with functional roles in activation of the NLRP3 inflammasome and microgliosis, respectively, were significantly upregulated in the hippocampus of 'susceptible' animals expressing increased behavioral emotionality. In addition, genes associated with blood-brain barrier integrity, such as the Claudin 4 (Cldn4), a tight junction protein and a known marker of astrocyte activation, were also significantly dysregulated between 'resilient' or 'susceptible' pain groups. Furthermore, differentially expressed genes (DEGs) were further characterized in rodents stress models to determine whether their hippocampal dysregulation is driven by common stress responses vs. affective pain processing. Altogether these results continue to strengthen the connection between dysregulation of hippocampal genes involved in neuroinflammatory and neurodegenerative processes with increased behavioral emotionality often expressed in chronic pain state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,102
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2023
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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